Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
HECW1Q76N89 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC42.44■■■■■ 4.38
HECW1Q76N89 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
HECW1Q76N89 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
HECW1Q76N89 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
HECW1Q76N89 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
HECW1Q76N89 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
HECW1Q76N89 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
HECW1Q76N89 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
HECW1Q76N89 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
HECW1Q76N89 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC42.36■■■■■ 4.37
HECW1Q76N89 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
HECW1Q76N89 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
HECW1Q76N89 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
HECW1Q76N89 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
HECW1Q76N89 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
HECW1Q76N89 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
HECW1Q76N89 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
HECW1Q76N89 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
HECW1Q76N89 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
HECW1Q76N89 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
HECW1Q76N89 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
HECW1Q76N89 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
HECW1Q76N89 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
HECW1Q76N89 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
HECW1Q76N89 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
HECW1Q76N89 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.28■■■■■ 4.36
HECW1Q76N89 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC42.28■■■■■ 4.36
HECW1Q76N89 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
HECW1Q76N89 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
HECW1Q76N89 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
HECW1Q76N89 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
HECW1Q76N89 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
HECW1Q76N89 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
HECW1Q76N89 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
HECW1Q76N89 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
HECW1Q76N89 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
HECW1Q76N89 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
HECW1Q76N89 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
HECW1Q76N89 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
HECW1Q76N89 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
HECW1Q76N89 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
HECW1Q76N89 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
HECW1Q76N89 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
HECW1Q76N89 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
HECW1Q76N89 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.13■■■■■ 4.34
HECW1Q76N89 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
HECW1Q76N89 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
HECW1Q76N89 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
HECW1Q76N89 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.1■■■■■ 4.33
HECW1Q76N89 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
HECW1Q76N89 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
HECW1Q76N89 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
HECW1Q76N89 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
HECW1Q76N89 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
HECW1Q76N89 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
HECW1Q76N89 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
HECW1Q76N89 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
HECW1Q76N89 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
HECW1Q76N89 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
HECW1Q76N89 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.05■■■■■ 4.32
HECW1Q76N89 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
HECW1Q76N89 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
HECW1Q76N89 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
HECW1Q76N89 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
HECW1Q76N89 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
HECW1Q76N89 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
HECW1Q76N89 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
HECW1Q76N89 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
HECW1Q76N89 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
HECW1Q76N89 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
HECW1Q76N89 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
HECW1Q76N89 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
HECW1Q76N89 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
HECW1Q76N89 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
HECW1Q76N89 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
HECW1Q76N89 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
HECW1Q76N89 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
HECW1Q76N89 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
HECW1Q76N89 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
HECW1Q76N89 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
HECW1Q76N89 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
HECW1Q76N89 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
HECW1Q76N89 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
HECW1Q76N89 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.95■■■■■ 4.31
HECW1Q76N89 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
HECW1Q76N89 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
HECW1Q76N89 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
HECW1Q76N89 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
HECW1Q76N89 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
HECW1Q76N89 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
HECW1Q76N89 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
HECW1Q76N89 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC41.85■■■■■ 4.29
HECW1Q76N89 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
HECW1Q76N89 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
HECW1Q76N89 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
HECW1Q76N89 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
HECW1Q76N89 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
HECW1Q76N89 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC41.82■■■■■ 4.29
HECW1Q76N89 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms