Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA1549LQ6ZVL6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA1549LQ6ZVL6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA1549LQ6ZVL6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA1549LQ6ZVL6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA1549LQ6ZVL6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA1549LQ6ZVL6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIAA1549LQ6ZVL6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA1549LQ6ZVL6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA1549LQ6ZVL6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA1549LQ6ZVL6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA1549LQ6ZVL6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA1549LQ6ZVL6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA1549LQ6ZVL6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA1549LQ6ZVL6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA1549LQ6ZVL6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA1549LQ6ZVL6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIAA1549LQ6ZVL6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KIAA1549LQ6ZVL6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA1549LQ6ZVL6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA1549LQ6ZVL6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIAA1549LQ6ZVL6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIAA1549LQ6ZVL6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA1549LQ6ZVL6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA1549LQ6ZVL6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KIAA1549LQ6ZVL6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIAA1549LQ6ZVL6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA1549LQ6ZVL6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA1549LQ6ZVL6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA1549LQ6ZVL6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA1549LQ6ZVL6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIAA1549LQ6ZVL6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KIAA1549LQ6ZVL6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA1549LQ6ZVL6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA1549LQ6ZVL6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA1549LQ6ZVL6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA1549LQ6ZVL6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIAA1549LQ6ZVL6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KIAA1549LQ6ZVL6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KIAA1549LQ6ZVL6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KIAA1549LQ6ZVL6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIAA1549LQ6ZVL6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KIAA1549LQ6ZVL6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIAA1549LQ6ZVL6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KIAA1549LQ6ZVL6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIAA1549LQ6ZVL6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIAA1549LQ6ZVL6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIAA1549LQ6ZVL6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIAA1549LQ6ZVL6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIAA1549LQ6ZVL6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIAA1549LQ6ZVL6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIAA1549LQ6ZVL6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIAA1549LQ6ZVL6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIAA1549LQ6ZVL6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIAA1549LQ6ZVL6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms