Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUFY4Q6ZNE9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUFY4Q6ZNE9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RUFY4Q6ZNE9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RUFY4Q6ZNE9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RUFY4Q6ZNE9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUFY4Q6ZNE9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RUFY4Q6ZNE9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RUFY4Q6ZNE9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RUFY4Q6ZNE9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUFY4Q6ZNE9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUFY4Q6ZNE9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUFY4Q6ZNE9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUFY4Q6ZNE9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RUFY4Q6ZNE9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RUFY4Q6ZNE9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RUFY4Q6ZNE9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RUFY4Q6ZNE9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RUFY4Q6ZNE9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RUFY4Q6ZNE9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RUFY4Q6ZNE9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RUFY4Q6ZNE9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RUFY4Q6ZNE9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RUFY4Q6ZNE9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RUFY4Q6ZNE9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RUFY4Q6ZNE9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RUFY4Q6ZNE9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RUFY4Q6ZNE9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY4Q6ZNE9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY4Q6ZNE9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUFY4Q6ZNE9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUFY4Q6ZNE9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RUFY4Q6ZNE9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUFY4Q6ZNE9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RUFY4Q6ZNE9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUFY4Q6ZNE9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUFY4Q6ZNE9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUFY4Q6ZNE9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUFY4Q6ZNE9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUFY4Q6ZNE9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RUFY4Q6ZNE9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUFY4Q6ZNE9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUFY4Q6ZNE9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUFY4Q6ZNE9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUFY4Q6ZNE9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RUFY4Q6ZNE9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RUFY4Q6ZNE9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RUFY4Q6ZNE9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RUFY4Q6ZNE9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RUFY4Q6ZNE9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RUFY4Q6ZNE9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RUFY4Q6ZNE9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RUFY4Q6ZNE9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RUFY4Q6ZNE9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUFY4Q6ZNE9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY4Q6ZNE9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY4Q6ZNE9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY4Q6ZNE9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RUFY4Q6ZNE9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RUFY4Q6ZNE9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RUFY4Q6ZNE9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RUFY4Q6ZNE9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RUFY4Q6ZNE9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUFY4Q6ZNE9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUFY4Q6ZNE9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUFY4Q6ZNE9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUFY4Q6ZNE9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RUFY4Q6ZNE9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RUFY4Q6ZNE9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RUFY4Q6ZNE9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RUFY4Q6ZNE9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RUFY4Q6ZNE9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RUFY4Q6ZNE9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RUFY4Q6ZNE9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RUFY4Q6ZNE9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUFY4Q6ZNE9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RUFY4Q6ZNE9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RUFY4Q6ZNE9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUFY4Q6ZNE9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUFY4Q6ZNE9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUFY4Q6ZNE9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms