Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Glis3Q6XP49 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Glis3Q6XP49 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Glis3Q6XP49 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Glis3Q6XP49 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Glis3Q6XP49 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Glis3Q6XP49 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Glis3Q6XP49 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Glis3Q6XP49 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Glis3Q6XP49 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Glis3Q6XP49 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Glis3Q6XP49 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Glis3Q6XP49 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Glis3Q6XP49 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Glis3Q6XP49 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Glis3Q6XP49 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Glis3Q6XP49 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Glis3Q6XP49 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Glis3Q6XP49 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Glis3Q6XP49 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Glis3Q6XP49 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Glis3Q6XP49 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Glis3Q6XP49 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Glis3Q6XP49 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Glis3Q6XP49 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Glis3Q6XP49 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Glis3Q6XP49 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Glis3Q6XP49 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Glis3Q6XP49 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Glis3Q6XP49 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Glis3Q6XP49 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Glis3Q6XP49 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Glis3Q6XP49 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Glis3Q6XP49 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Glis3Q6XP49 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Glis3Q6XP49 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Glis3Q6XP49 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Glis3Q6XP49 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Glis3Q6XP49 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Glis3Q6XP49 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Glis3Q6XP49 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Glis3Q6XP49 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Glis3Q6XP49 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Glis3Q6XP49 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Glis3Q6XP49 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Glis3Q6XP49 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Glis3Q6XP49 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Glis3Q6XP49 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Glis3Q6XP49 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Glis3Q6XP49 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Glis3Q6XP49 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Glis3Q6XP49 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Glis3Q6XP49 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Glis3Q6XP49 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Glis3Q6XP49 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Glis3Q6XP49 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Glis3Q6XP49 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Glis3Q6XP49 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Glis3Q6XP49 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Glis3Q6XP49 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Glis3Q6XP49 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Glis3Q6XP49 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Glis3Q6XP49 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Glis3Q6XP49 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Glis3Q6XP49 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Glis3Q6XP49 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Glis3Q6XP49 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Glis3Q6XP49 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Glis3Q6XP49 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Glis3Q6XP49 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Glis3Q6XP49 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Glis3Q6XP49 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Glis3Q6XP49 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Glis3Q6XP49 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Glis3Q6XP49 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Glis3Q6XP49 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Glis3Q6XP49 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Glis3Q6XP49 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Glis3Q6XP49 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Glis3Q6XP49 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Glis3Q6XP49 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8431.7 ms