Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLPSL2Q6UWE3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLPSL2Q6UWE3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLPSL2Q6UWE3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPSL2Q6UWE3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPSL2Q6UWE3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLPSL2Q6UWE3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPSL2Q6UWE3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLPSL2Q6UWE3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPSL2Q6UWE3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLPSL2Q6UWE3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPSL2Q6UWE3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLPSL2Q6UWE3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms