Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC144NLQ6NUI1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC144NLQ6NUI1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC144NLQ6NUI1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC144NLQ6NUI1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC144NLQ6NUI1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC144NLQ6NUI1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC144NLQ6NUI1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC144NLQ6NUI1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC144NLQ6NUI1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC144NLQ6NUI1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC144NLQ6NUI1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC144NLQ6NUI1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC144NLQ6NUI1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC144NLQ6NUI1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC144NLQ6NUI1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC144NLQ6NUI1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC144NLQ6NUI1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC144NLQ6NUI1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC144NLQ6NUI1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC144NLQ6NUI1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC144NLQ6NUI1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC144NLQ6NUI1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC144NLQ6NUI1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC144NLQ6NUI1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC144NLQ6NUI1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC144NLQ6NUI1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC144NLQ6NUI1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms