Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZP7

LIN54, Protein lin-54 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN54Q6MZP7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN54Q6MZP7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN54Q6MZP7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN54Q6MZP7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN54Q6MZP7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN54Q6MZP7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN54Q6MZP7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN54Q6MZP7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN54Q6MZP7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN54Q6MZP7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN54Q6MZP7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN54Q6MZP7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIN54Q6MZP7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN54Q6MZP7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN54Q6MZP7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms