Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RALGAPA1Q6GYQ0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RALGAPA1Q6GYQ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RALGAPA1Q6GYQ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RALGAPA1Q6GYQ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RALGAPA1Q6GYQ0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RALGAPA1Q6GYQ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RALGAPA1Q6GYQ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RALGAPA1Q6GYQ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RALGAPA1Q6GYQ0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RALGAPA1Q6GYQ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RALGAPA1Q6GYQ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RALGAPA1Q6GYQ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RALGAPA1Q6GYQ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RALGAPA1Q6GYQ0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RALGAPA1Q6GYQ0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RALGAPA1Q6GYQ0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RALGAPA1Q6GYQ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RALGAPA1Q6GYQ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RALGAPA1Q6GYQ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RALGAPA1Q6GYQ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RALGAPA1Q6GYQ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RALGAPA1Q6GYQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RALGAPA1Q6GYQ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RALGAPA1Q6GYQ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RALGAPA1Q6GYQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RALGAPA1Q6GYQ0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RALGAPA1Q6GYQ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RALGAPA1Q6GYQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RALGAPA1Q6GYQ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RALGAPA1Q6GYQ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RALGAPA1Q6GYQ0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RALGAPA1Q6GYQ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RALGAPA1Q6GYQ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RALGAPA1Q6GYQ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RALGAPA1Q6GYQ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RALGAPA1Q6GYQ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RALGAPA1Q6GYQ0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RALGAPA1Q6GYQ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RALGAPA1Q6GYQ0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RALGAPA1Q6GYQ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RALGAPA1Q6GYQ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RALGAPA1Q6GYQ0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RALGAPA1Q6GYQ0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RALGAPA1Q6GYQ0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RALGAPA1Q6GYQ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RALGAPA1Q6GYQ0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RALGAPA1Q6GYQ0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RALGAPA1Q6GYQ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RALGAPA1Q6GYQ0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RALGAPA1Q6GYQ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RALGAPA1Q6GYQ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RALGAPA1Q6GYQ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RALGAPA1Q6GYQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RALGAPA1Q6GYQ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RALGAPA1Q6GYQ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RALGAPA1Q6GYQ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RALGAPA1Q6GYQ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RALGAPA1Q6GYQ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RALGAPA1Q6GYQ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RALGAPA1Q6GYQ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RALGAPA1Q6GYQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RALGAPA1Q6GYQ0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RALGAPA1Q6GYQ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RALGAPA1Q6GYQ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RALGAPA1Q6GYQ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RALGAPA1Q6GYQ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RALGAPA1Q6GYQ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RALGAPA1Q6GYQ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms