Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
VIRMAQ69YN4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
VIRMAQ69YN4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
VIRMAQ69YN4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
VIRMAQ69YN4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
VIRMAQ69YN4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
VIRMAQ69YN4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
VIRMAQ69YN4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
VIRMAQ69YN4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
VIRMAQ69YN4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
VIRMAQ69YN4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
VIRMAQ69YN4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
VIRMAQ69YN4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
VIRMAQ69YN4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
VIRMAQ69YN4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
VIRMAQ69YN4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
VIRMAQ69YN4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
VIRMAQ69YN4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
VIRMAQ69YN4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
VIRMAQ69YN4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
VIRMAQ69YN4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
VIRMAQ69YN4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
VIRMAQ69YN4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
VIRMAQ69YN4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
VIRMAQ69YN4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
VIRMAQ69YN4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
VIRMAQ69YN4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.07■■■■□ 3.2
VIRMAQ69YN4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
VIRMAQ69YN4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
VIRMAQ69YN4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
VIRMAQ69YN4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
VIRMAQ69YN4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
VIRMAQ69YN4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
VIRMAQ69YN4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
VIRMAQ69YN4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
VIRMAQ69YN4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
VIRMAQ69YN4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
VIRMAQ69YN4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
VIRMAQ69YN4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
VIRMAQ69YN4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
VIRMAQ69YN4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
VIRMAQ69YN4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
VIRMAQ69YN4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
VIRMAQ69YN4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
VIRMAQ69YN4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
VIRMAQ69YN4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
VIRMAQ69YN4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
VIRMAQ69YN4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
VIRMAQ69YN4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
VIRMAQ69YN4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
VIRMAQ69YN4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
VIRMAQ69YN4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
VIRMAQ69YN4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
VIRMAQ69YN4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
VIRMAQ69YN4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
VIRMAQ69YN4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
VIRMAQ69YN4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
VIRMAQ69YN4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
VIRMAQ69YN4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
VIRMAQ69YN4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
VIRMAQ69YN4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
VIRMAQ69YN4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
VIRMAQ69YN4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
VIRMAQ69YN4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.83■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
VIRMAQ69YN4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
VIRMAQ69YN4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
VIRMAQ69YN4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms