Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PmelQ60696 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PmelQ60696 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PmelQ60696 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PmelQ60696 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PmelQ60696 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PmelQ60696 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PmelQ60696 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PmelQ60696 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PmelQ60696 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PmelQ60696 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PmelQ60696 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PmelQ60696 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PmelQ60696 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PmelQ60696 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PmelQ60696 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PmelQ60696 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PmelQ60696 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PmelQ60696 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PmelQ60696 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PmelQ60696 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PmelQ60696 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PmelQ60696 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PmelQ60696 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PmelQ60696 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PmelQ60696 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PmelQ60696 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PmelQ60696 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PmelQ60696 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PmelQ60696 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PmelQ60696 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PmelQ60696 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PmelQ60696 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PmelQ60696 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PmelQ60696 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PmelQ60696 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PmelQ60696 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PmelQ60696 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PmelQ60696 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PmelQ60696 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PmelQ60696 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PmelQ60696 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PmelQ60696 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PmelQ60696 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PmelQ60696 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PmelQ60696 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PmelQ60696 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PmelQ60696 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PmelQ60696 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PmelQ60696 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PmelQ60696 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PmelQ60696 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PmelQ60696 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PmelQ60696 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PmelQ60696 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PmelQ60696 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PmelQ60696 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PmelQ60696 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PmelQ60696 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmelQ60696 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmelQ60696 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmelQ60696 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmelQ60696 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PmelQ60696 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PmelQ60696 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PmelQ60696 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PmelQ60696 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PmelQ60696 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PmelQ60696 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmelQ60696 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmelQ60696 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmelQ60696 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmelQ60696 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PmelQ60696 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmelQ60696 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmelQ60696 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PmelQ60696 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PmelQ60696 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PmelQ60696 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmelQ60696 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PmelQ60696 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PmelQ60696 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PmelQ60696 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms