Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAPD7Q5XG87 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAPD7Q5XG87 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAPD7Q5XG87 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAPD7Q5XG87 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAPD7Q5XG87 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAPD7Q5XG87 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAPD7Q5XG87 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAPD7Q5XG87 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PAPD7Q5XG87 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAPD7Q5XG87 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAPD7Q5XG87 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAPD7Q5XG87 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAPD7Q5XG87 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PAPD7Q5XG87 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAPD7Q5XG87 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAPD7Q5XG87 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAPD7Q5XG87 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAPD7Q5XG87 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAPD7Q5XG87 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAPD7Q5XG87 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAPD7Q5XG87 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAPD7Q5XG87 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAPD7Q5XG87 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAPD7Q5XG87 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAPD7Q5XG87 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAPD7Q5XG87 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAPD7Q5XG87 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAPD7Q5XG87 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAPD7Q5XG87 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAPD7Q5XG87 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAPD7Q5XG87 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAPD7Q5XG87 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAPD7Q5XG87 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAPD7Q5XG87 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAPD7Q5XG87 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPD7Q5XG87 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPD7Q5XG87 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPD7Q5XG87 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPD7Q5XG87 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPD7Q5XG87 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAPD7Q5XG87 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPD7Q5XG87 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPD7Q5XG87 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPD7Q5XG87 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPD7Q5XG87 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPD7Q5XG87 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPD7Q5XG87 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPD7Q5XG87 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPD7Q5XG87 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPD7Q5XG87 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPD7Q5XG87 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPD7Q5XG87 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPD7Q5XG87 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAPD7Q5XG87 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAPD7Q5XG87 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PAPD7Q5XG87 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PAPD7Q5XG87 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PAPD7Q5XG87 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAPD7Q5XG87 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAPD7Q5XG87 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAPD7Q5XG87 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAPD7Q5XG87 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAPD7Q5XG87 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAPD7Q5XG87 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PAPD7Q5XG87 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PAPD7Q5XG87 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PAPD7Q5XG87 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAPD7Q5XG87 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PAPD7Q5XG87 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAPD7Q5XG87 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAPD7Q5XG87 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAPD7Q5XG87 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PAPD7Q5XG87 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PAPD7Q5XG87 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PAPD7Q5XG87 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAPD7Q5XG87 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAPD7Q5XG87 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAPD7Q5XG87 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PAPD7Q5XG87 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAPD7Q5XG87 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAPD7Q5XG87 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAPD7Q5XG87 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAPD7Q5XG87 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PAPD7Q5XG87 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAPD7Q5XG87 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAPD7Q5XG87 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAPD7Q5XG87 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAPD7Q5XG87 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAPD7Q5XG87 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAPD7Q5XG87 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAPD7Q5XG87 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PAPD7Q5XG87 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PAPD7Q5XG87 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAPD7Q5XG87 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAPD7Q5XG87 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PAPD7Q5XG87 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAPD7Q5XG87 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAPD7Q5XG87 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAPD7Q5XG87 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms