Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
RPRD2Q5VT52 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
RPRD2Q5VT52 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
RPRD2Q5VT52 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
RPRD2Q5VT52 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
RPRD2Q5VT52 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
RPRD2Q5VT52 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
RPRD2Q5VT52 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
RPRD2Q5VT52 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
RPRD2Q5VT52 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
RPRD2Q5VT52 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
RPRD2Q5VT52 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
RPRD2Q5VT52 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
RPRD2Q5VT52 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
RPRD2Q5VT52 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.65■■■■□ 3.94
RPRD2Q5VT52 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
RPRD2Q5VT52 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
RPRD2Q5VT52 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
RPRD2Q5VT52 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
RPRD2Q5VT52 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
RPRD2Q5VT52 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
RPRD2Q5VT52 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
RPRD2Q5VT52 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
RPRD2Q5VT52 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
RPRD2Q5VT52 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
RPRD2Q5VT52 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
RPRD2Q5VT52 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
RPRD2Q5VT52 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
RPRD2Q5VT52 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
RPRD2Q5VT52 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
RPRD2Q5VT52 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
RPRD2Q5VT52 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
RPRD2Q5VT52 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
RPRD2Q5VT52 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
RPRD2Q5VT52 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
RPRD2Q5VT52 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
RPRD2Q5VT52 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
RPRD2Q5VT52 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
RPRD2Q5VT52 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
RPRD2Q5VT52 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
RPRD2Q5VT52 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
RPRD2Q5VT52 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
RPRD2Q5VT52 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
RPRD2Q5VT52 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
RPRD2Q5VT52 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.49■■■■□ 3.91
RPRD2Q5VT52 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
RPRD2Q5VT52 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
RPRD2Q5VT52 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
RPRD2Q5VT52 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
RPRD2Q5VT52 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
RPRD2Q5VT52 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
RPRD2Q5VT52 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
RPRD2Q5VT52 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
RPRD2Q5VT52 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
RPRD2Q5VT52 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
RPRD2Q5VT52 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
RPRD2Q5VT52 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.39■■■■□ 3.9
RPRD2Q5VT52 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
RPRD2Q5VT52 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
RPRD2Q5VT52 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
RPRD2Q5VT52 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
RPRD2Q5VT52 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
RPRD2Q5VT52 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
RPRD2Q5VT52 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
RPRD2Q5VT52 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
RPRD2Q5VT52 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
RPRD2Q5VT52 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
RPRD2Q5VT52 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
RPRD2Q5VT52 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
RPRD2Q5VT52 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
RPRD2Q5VT52 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
RPRD2Q5VT52 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
RPRD2Q5VT52 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RPRD2Q5VT52 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RPRD2Q5VT52 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
RPRD2Q5VT52 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
RPRD2Q5VT52 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RPRD2Q5VT52 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.28■■■■□ 3.88
RPRD2Q5VT52 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
RPRD2Q5VT52 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.27■■■■□ 3.88
RPRD2Q5VT52 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
RPRD2Q5VT52 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
RPRD2Q5VT52 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
RPRD2Q5VT52 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
RPRD2Q5VT52 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.24■■■■□ 3.87
RPRD2Q5VT52 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
RPRD2Q5VT52 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
RPRD2Q5VT52 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
RPRD2Q5VT52 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
RPRD2Q5VT52 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RPRD2Q5VT52 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
RPRD2Q5VT52 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
RPRD2Q5VT52 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
RPRD2Q5VT52 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RPRD2Q5VT52 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
RPRD2Q5VT52 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RPRD2Q5VT52 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RPRD2Q5VT52 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RPRD2Q5VT52 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
RPRD2Q5VT52 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms