Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP47Q5SQN1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP47Q5SQN1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP47Q5SQN1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP47Q5SQN1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP47Q5SQN1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP47Q5SQN1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP47Q5SQN1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP47Q5SQN1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP47Q5SQN1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP47Q5SQN1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP47Q5SQN1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP47Q5SQN1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP47Q5SQN1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP47Q5SQN1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP47Q5SQN1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP47Q5SQN1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP47Q5SQN1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP47Q5SQN1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP47Q5SQN1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP47Q5SQN1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP47Q5SQN1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP47Q5SQN1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP47Q5SQN1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP47Q5SQN1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP47Q5SQN1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP47Q5SQN1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP47Q5SQN1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP47Q5SQN1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP47Q5SQN1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNAP47Q5SQN1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNAP47Q5SQN1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNAP47Q5SQN1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNAP47Q5SQN1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP47Q5SQN1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP47Q5SQN1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP47Q5SQN1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNAP47Q5SQN1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAP47Q5SQN1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAP47Q5SQN1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNAP47Q5SQN1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAP47Q5SQN1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNAP47Q5SQN1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP47Q5SQN1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP47Q5SQN1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP47Q5SQN1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP47Q5SQN1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNAP47Q5SQN1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAP47Q5SQN1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAP47Q5SQN1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms