Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
HS1BP3Q53T59 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HS1BP3Q53T59 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HS1BP3Q53T59 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HS1BP3Q53T59 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HS1BP3Q53T59 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HS1BP3Q53T59 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HS1BP3Q53T59 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HS1BP3Q53T59 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HS1BP3Q53T59 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HS1BP3Q53T59 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HS1BP3Q53T59 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HS1BP3Q53T59 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
HS1BP3Q53T59 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HS1BP3Q53T59 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HS1BP3Q53T59 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HS1BP3Q53T59 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HS1BP3Q53T59 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HS1BP3Q53T59 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HS1BP3Q53T59 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HS1BP3Q53T59 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HS1BP3Q53T59 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HS1BP3Q53T59 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HS1BP3Q53T59 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HS1BP3Q53T59 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HS1BP3Q53T59 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HS1BP3Q53T59 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HS1BP3Q53T59 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HS1BP3Q53T59 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HS1BP3Q53T59 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HS1BP3Q53T59 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HS1BP3Q53T59 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HS1BP3Q53T59 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HS1BP3Q53T59 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HS1BP3Q53T59 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HS1BP3Q53T59 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HS1BP3Q53T59 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HS1BP3Q53T59 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HS1BP3Q53T59 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HS1BP3Q53T59 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HS1BP3Q53T59 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HS1BP3Q53T59 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HS1BP3Q53T59 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HS1BP3Q53T59 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HS1BP3Q53T59 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HS1BP3Q53T59 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HS1BP3Q53T59 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
HS1BP3Q53T59 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HS1BP3Q53T59 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HS1BP3Q53T59 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HS1BP3Q53T59 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HS1BP3Q53T59 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HS1BP3Q53T59 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HS1BP3Q53T59 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HS1BP3Q53T59 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HS1BP3Q53T59 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HS1BP3Q53T59 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HS1BP3Q53T59 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HS1BP3Q53T59 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HS1BP3Q53T59 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HS1BP3Q53T59 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HS1BP3Q53T59 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HS1BP3Q53T59 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HS1BP3Q53T59 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HS1BP3Q53T59 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
HS1BP3Q53T59 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HS1BP3Q53T59 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HS1BP3Q53T59 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HS1BP3Q53T59 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HS1BP3Q53T59 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HS1BP3Q53T59 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HS1BP3Q53T59 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HS1BP3Q53T59 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HS1BP3Q53T59 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HS1BP3Q53T59 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HS1BP3Q53T59 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HS1BP3Q53T59 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HS1BP3Q53T59 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HS1BP3Q53T59 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HS1BP3Q53T59 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HS1BP3Q53T59 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HS1BP3Q53T59 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HS1BP3Q53T59 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
HS1BP3Q53T59 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HS1BP3Q53T59 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HS1BP3Q53T59 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HS1BP3Q53T59 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HS1BP3Q53T59 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HS1BP3Q53T59 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HS1BP3Q53T59 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HS1BP3Q53T59 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HS1BP3Q53T59 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HS1BP3Q53T59 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HS1BP3Q53T59 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HS1BP3Q53T59 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HS1BP3Q53T59 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HS1BP3Q53T59 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HS1BP3Q53T59 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HS1BP3Q53T59 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HS1BP3Q53T59 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms