Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSD17B12Q53GQ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSD17B12Q53GQ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSD17B12Q53GQ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSD17B12Q53GQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSD17B12Q53GQ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms