Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF260Q3ZCT1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF260Q3ZCT1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF260Q3ZCT1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF260Q3ZCT1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF260Q3ZCT1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF260Q3ZCT1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF260Q3ZCT1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF260Q3ZCT1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF260Q3ZCT1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF260Q3ZCT1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF260Q3ZCT1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF260Q3ZCT1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF260Q3ZCT1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF260Q3ZCT1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF260Q3ZCT1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF260Q3ZCT1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF260Q3ZCT1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF260Q3ZCT1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF260Q3ZCT1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF260Q3ZCT1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF260Q3ZCT1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF260Q3ZCT1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF260Q3ZCT1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF260Q3ZCT1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF260Q3ZCT1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF260Q3ZCT1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF260Q3ZCT1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF260Q3ZCT1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF260Q3ZCT1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF260Q3ZCT1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF260Q3ZCT1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF260Q3ZCT1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF260Q3ZCT1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF260Q3ZCT1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF260Q3ZCT1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF260Q3ZCT1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF260Q3ZCT1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF260Q3ZCT1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF260Q3ZCT1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF260Q3ZCT1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF260Q3ZCT1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF260Q3ZCT1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF260Q3ZCT1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF260Q3ZCT1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF260Q3ZCT1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF260Q3ZCT1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF260Q3ZCT1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF260Q3ZCT1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF260Q3ZCT1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF260Q3ZCT1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF260Q3ZCT1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF260Q3ZCT1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF260Q3ZCT1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF260Q3ZCT1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms