Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD1

Adgrb1, Adhesion G protein-coupled receptor B1, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adgrb1Q3UHD1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Adgrb1Q3UHD1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Adgrb1Q3UHD1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Adgrb1Q3UHD1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Adgrb1Q3UHD1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Adgrb1Q3UHD1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Adgrb1Q3UHD1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Adgrb1Q3UHD1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Adgrb1Q3UHD1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Adgrb1Q3UHD1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Adgrb1Q3UHD1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Adgrb1Q3UHD1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Adgrb1Q3UHD1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Adgrb1Q3UHD1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Adgrb1Q3UHD1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Adgrb1Q3UHD1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Adgrb1Q3UHD1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Adgrb1Q3UHD1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Adgrb1Q3UHD1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Adgrb1Q3UHD1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Adgrb1Q3UHD1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Adgrb1Q3UHD1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Adgrb1Q3UHD1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Adgrb1Q3UHD1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Adgrb1Q3UHD1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Adgrb1Q3UHD1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Adgrb1Q3UHD1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Adgrb1Q3UHD1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Adgrb1Q3UHD1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Adgrb1Q3UHD1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Adgrb1Q3UHD1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Adgrb1Q3UHD1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Adgrb1Q3UHD1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Adgrb1Q3UHD1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Adgrb1Q3UHD1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Adgrb1Q3UHD1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Adgrb1Q3UHD1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Adgrb1Q3UHD1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Adgrb1Q3UHD1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Adgrb1Q3UHD1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Adgrb1Q3UHD1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Adgrb1Q3UHD1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Adgrb1Q3UHD1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Adgrb1Q3UHD1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Adgrb1Q3UHD1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Adgrb1Q3UHD1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Adgrb1Q3UHD1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Adgrb1Q3UHD1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Adgrb1Q3UHD1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Adgrb1Q3UHD1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Adgrb1Q3UHD1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Adgrb1Q3UHD1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Adgrb1Q3UHD1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Adgrb1Q3UHD1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Adgrb1Q3UHD1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Adgrb1Q3UHD1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Adgrb1Q3UHD1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Adgrb1Q3UHD1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Adgrb1Q3UHD1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Adgrb1Q3UHD1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Adgrb1Q3UHD1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Adgrb1Q3UHD1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Adgrb1Q3UHD1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Adgrb1Q3UHD1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Adgrb1Q3UHD1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Adgrb1Q3UHD1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Adgrb1Q3UHD1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Adgrb1Q3UHD1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Adgrb1Q3UHD1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Adgrb1Q3UHD1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Adgrb1Q3UHD1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Adgrb1Q3UHD1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Adgrb1Q3UHD1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Adgrb1Q3UHD1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Adgrb1Q3UHD1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Adgrb1Q3UHD1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Adgrb1Q3UHD1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Adgrb1Q3UHD1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Adgrb1Q3UHD1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Adgrb1Q3UHD1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Adgrb1Q3UHD1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Adgrb1Q3UHD1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Adgrb1Q3UHD1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Adgrb1Q3UHD1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Adgrb1Q3UHD1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Adgrb1Q3UHD1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Adgrb1Q3UHD1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Adgrb1Q3UHD1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Adgrb1Q3UHD1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Adgrb1Q3UHD1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Adgrb1Q3UHD1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Adgrb1Q3UHD1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Adgrb1Q3UHD1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Adgrb1Q3UHD1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Adgrb1Q3UHD1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Adgrb1Q3UHD1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Adgrb1Q3UHD1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Adgrb1Q3UHD1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Adgrb1Q3UHD1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Adgrb1Q3UHD1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms