Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Hhla1Q3TYV2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hhla1Q3TYV2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hhla1Q3TYV2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hhla1Q3TYV2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hhla1Q3TYV2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hhla1Q3TYV2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Hhla1Q3TYV2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hhla1Q3TYV2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hhla1Q3TYV2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hhla1Q3TYV2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hhla1Q3TYV2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hhla1Q3TYV2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hhla1Q3TYV2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hhla1Q3TYV2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hhla1Q3TYV2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hhla1Q3TYV2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hhla1Q3TYV2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hhla1Q3TYV2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Hhla1Q3TYV2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hhla1Q3TYV2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hhla1Q3TYV2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hhla1Q3TYV2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hhla1Q3TYV2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hhla1Q3TYV2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hhla1Q3TYV2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hhla1Q3TYV2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Hhla1Q3TYV2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hhla1Q3TYV2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hhla1Q3TYV2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hhla1Q3TYV2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hhla1Q3TYV2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Hhla1Q3TYV2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hhla1Q3TYV2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hhla1Q3TYV2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hhla1Q3TYV2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hhla1Q3TYV2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hhla1Q3TYV2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hhla1Q3TYV2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hhla1Q3TYV2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hhla1Q3TYV2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hhla1Q3TYV2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hhla1Q3TYV2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hhla1Q3TYV2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hhla1Q3TYV2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hhla1Q3TYV2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hhla1Q3TYV2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Hhla1Q3TYV2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hhla1Q3TYV2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hhla1Q3TYV2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hhla1Q3TYV2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hhla1Q3TYV2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Hhla1Q3TYV2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hhla1Q3TYV2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hhla1Q3TYV2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hhla1Q3TYV2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hhla1Q3TYV2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hhla1Q3TYV2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hhla1Q3TYV2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hhla1Q3TYV2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hhla1Q3TYV2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hhla1Q3TYV2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Hhla1Q3TYV2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hhla1Q3TYV2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hhla1Q3TYV2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hhla1Q3TYV2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hhla1Q3TYV2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hhla1Q3TYV2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hhla1Q3TYV2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hhla1Q3TYV2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hhla1Q3TYV2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hhla1Q3TYV2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hhla1Q3TYV2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hhla1Q3TYV2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hhla1Q3TYV2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hhla1Q3TYV2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hhla1Q3TYV2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hhla1Q3TYV2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hhla1Q3TYV2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hhla1Q3TYV2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hhla1Q3TYV2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Hhla1Q3TYV2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hhla1Q3TYV2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hhla1Q3TYV2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hhla1Q3TYV2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hhla1Q3TYV2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hhla1Q3TYV2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hhla1Q3TYV2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hhla1Q3TYV2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hhla1Q3TYV2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hhla1Q3TYV2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hhla1Q3TYV2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hhla1Q3TYV2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hhla1Q3TYV2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hhla1Q3TYV2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hhla1Q3TYV2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hhla1Q3TYV2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hhla1Q3TYV2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hhla1Q3TYV2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hhla1Q3TYV2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms