Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A9Q2M3M2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC5A9Q2M3M2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC5A9Q2M3M2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC5A9Q2M3M2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC5A9Q2M3M2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC5A9Q2M3M2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC5A9Q2M3M2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC5A9Q2M3M2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC5A9Q2M3M2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC5A9Q2M3M2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC5A9Q2M3M2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC5A9Q2M3M2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC5A9Q2M3M2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC5A9Q2M3M2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC5A9Q2M3M2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC5A9Q2M3M2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC5A9Q2M3M2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC5A9Q2M3M2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC5A9Q2M3M2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC5A9Q2M3M2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC5A9Q2M3M2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC5A9Q2M3M2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC5A9Q2M3M2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC5A9Q2M3M2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC5A9Q2M3M2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC5A9Q2M3M2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC5A9Q2M3M2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A9Q2M3M2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A9Q2M3M2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC5A9Q2M3M2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A9Q2M3M2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A9Q2M3M2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A9Q2M3M2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A9Q2M3M2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC5A9Q2M3M2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC5A9Q2M3M2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC5A9Q2M3M2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC5A9Q2M3M2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC5A9Q2M3M2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A9Q2M3M2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A9Q2M3M2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A9Q2M3M2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC5A9Q2M3M2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC5A9Q2M3M2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC5A9Q2M3M2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC5A9Q2M3M2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC5A9Q2M3M2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms