Protein–RNA interactions for Protein: Q16513

PKN2, Serine/threonine-protein kinase N2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN2Q16513 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PKN2Q16513 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKN2Q16513 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKN2Q16513 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PKN2Q16513 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PKN2Q16513 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
PKN2Q16513 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PKN2Q16513 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PKN2Q16513 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKN2Q16513 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKN2Q16513 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKN2Q16513 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKN2Q16513 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKN2Q16513 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKN2Q16513 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKN2Q16513 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKN2Q16513 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKN2Q16513 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKN2Q16513 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKN2Q16513 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PKN2Q16513 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKN2Q16513 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKN2Q16513 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKN2Q16513 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PKN2Q16513 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PKN2Q16513 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PKN2Q16513 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PKN2Q16513 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PKN2Q16513 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PKN2Q16513 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PKN2Q16513 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PKN2Q16513 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PKN2Q16513 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PKN2Q16513 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PKN2Q16513 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PKN2Q16513 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PKN2Q16513 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PKN2Q16513 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PKN2Q16513 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PKN2Q16513 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PKN2Q16513 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PKN2Q16513 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PKN2Q16513 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PKN2Q16513 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PKN2Q16513 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PKN2Q16513 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PKN2Q16513 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PKN2Q16513 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PKN2Q16513 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKN2Q16513 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKN2Q16513 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PKN2Q16513 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PKN2Q16513 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PKN2Q16513 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PKN2Q16513 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PKN2Q16513 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKN2Q16513 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKN2Q16513 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKN2Q16513 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKN2Q16513 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKN2Q16513 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKN2Q16513 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKN2Q16513 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKN2Q16513 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKN2Q16513 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PKN2Q16513 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PKN2Q16513 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PKN2Q16513 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PKN2Q16513 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PKN2Q16513 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PKN2Q16513 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKN2Q16513 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKN2Q16513 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKN2Q16513 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PKN2Q16513 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKN2Q16513 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKN2Q16513 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKN2Q16513 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKN2Q16513 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKN2Q16513 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKN2Q16513 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKN2Q16513 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms