Protein–RNA interactions for Protein: Q15303

ERBB4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB4Q15303 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERBB4Q15303 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERBB4Q15303 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERBB4Q15303 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERBB4Q15303 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
ERBB4Q15303 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERBB4Q15303 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERBB4Q15303 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ERBB4Q15303 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ERBB4Q15303 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ERBB4Q15303 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ERBB4Q15303 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ERBB4Q15303 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ERBB4Q15303 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ERBB4Q15303 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ERBB4Q15303 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ERBB4Q15303 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERBB4Q15303 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERBB4Q15303 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ERBB4Q15303 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ERBB4Q15303 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ERBB4Q15303 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ERBB4Q15303 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ERBB4Q15303 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ERBB4Q15303 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERBB4Q15303 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERBB4Q15303 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ERBB4Q15303 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERBB4Q15303 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERBB4Q15303 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERBB4Q15303 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERBB4Q15303 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERBB4Q15303 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERBB4Q15303 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERBB4Q15303 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
ERBB4Q15303 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERBB4Q15303 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERBB4Q15303 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERBB4Q15303 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERBB4Q15303 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERBB4Q15303 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ERBB4Q15303 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ERBB4Q15303 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ERBB4Q15303 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ERBB4Q15303 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ERBB4Q15303 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ERBB4Q15303 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ERBB4Q15303 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ERBB4Q15303 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ERBB4Q15303 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ERBB4Q15303 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ERBB4Q15303 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
ERBB4Q15303 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ERBB4Q15303 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ERBB4Q15303 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ERBB4Q15303 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERBB4Q15303 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERBB4Q15303 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERBB4Q15303 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERBB4Q15303 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERBB4Q15303 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERBB4Q15303 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ERBB4Q15303 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ERBB4Q15303 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ERBB4Q15303 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ERBB4Q15303 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ERBB4Q15303 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ERBB4Q15303 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ERBB4Q15303 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ERBB4Q15303 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ERBB4Q15303 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ERBB4Q15303 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ERBB4Q15303 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ERBB4Q15303 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ERBB4Q15303 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ERBB4Q15303 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ERBB4Q15303 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ERBB4Q15303 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ERBB4Q15303 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ERBB4Q15303 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ERBB4Q15303 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ERBB4Q15303 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms