Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPRIN1Q14444 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPRIN1Q14444 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPRIN1Q14444 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPRIN1Q14444 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPRIN1Q14444 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPRIN1Q14444 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPRIN1Q14444 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPRIN1Q14444 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPRIN1Q14444 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPRIN1Q14444 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPRIN1Q14444 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPRIN1Q14444 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPRIN1Q14444 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPRIN1Q14444 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPRIN1Q14444 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPRIN1Q14444 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPRIN1Q14444 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPRIN1Q14444 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPRIN1Q14444 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPRIN1Q14444 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPRIN1Q14444 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPRIN1Q14444 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPRIN1Q14444 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPRIN1Q14444 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPRIN1Q14444 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPRIN1Q14444 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPRIN1Q14444 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPRIN1Q14444 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPRIN1Q14444 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPRIN1Q14444 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPRIN1Q14444 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPRIN1Q14444 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPRIN1Q14444 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPRIN1Q14444 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPRIN1Q14444 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPRIN1Q14444 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPRIN1Q14444 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPRIN1Q14444 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPRIN1Q14444 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPRIN1Q14444 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPRIN1Q14444 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPRIN1Q14444 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPRIN1Q14444 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPRIN1Q14444 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPRIN1Q14444 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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