Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHAF1AQ13111 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHAF1AQ13111 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CHAF1AQ13111 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHAF1AQ13111 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHAF1AQ13111 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
CHAF1AQ13111 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms