Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TP53BP1Q12888 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TP53BP1Q12888 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TP53BP1Q12888 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TP53BP1Q12888 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TP53BP1Q12888 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TP53BP1Q12888 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TP53BP1Q12888 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TP53BP1Q12888 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TP53BP1Q12888 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TP53BP1Q12888 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TP53BP1Q12888 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TP53BP1Q12888 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TP53BP1Q12888 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TP53BP1Q12888 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TP53BP1Q12888 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TP53BP1Q12888 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TP53BP1Q12888 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TP53BP1Q12888 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TP53BP1Q12888 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TP53BP1Q12888 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TP53BP1Q12888 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TP53BP1Q12888 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TP53BP1Q12888 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TP53BP1Q12888 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TP53BP1Q12888 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TP53BP1Q12888 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TP53BP1Q12888 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TP53BP1Q12888 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TP53BP1Q12888 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TP53BP1Q12888 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TP53BP1Q12888 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TP53BP1Q12888 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TP53BP1Q12888 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TP53BP1Q12888 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TP53BP1Q12888 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TP53BP1Q12888 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TP53BP1Q12888 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TP53BP1Q12888 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TP53BP1Q12888 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TP53BP1Q12888 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TP53BP1Q12888 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TP53BP1Q12888 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TP53BP1Q12888 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TP53BP1Q12888 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TP53BP1Q12888 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TP53BP1Q12888 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TP53BP1Q12888 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TP53BP1Q12888 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TP53BP1Q12888 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TP53BP1Q12888 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TP53BP1Q12888 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TP53BP1Q12888 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TP53BP1Q12888 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TP53BP1Q12888 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TP53BP1Q12888 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TP53BP1Q12888 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TP53BP1Q12888 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TP53BP1Q12888 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms