Protein–RNA interactions for Protein: Q12674

DNF3, Probable phospholipid-transporting ATPase DNF3, yeastyeast

Predictions only

Length 1,656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNF3Q12674 YCR025CYCR025C 411 nt13.05□□□□□ -0.32
DNF3Q12674 UTR1YJR049C 1593 nt13.05□□□□□ -0.32
DNF3Q12674 POT1YIL160C 1254 nt13□□□□□ -0.33
DNF3Q12674 FUR4YBR021W 1902 nt12.98□□□□□ -0.33
DNF3Q12674 MFG1YDL233W 1377 nt12.97□□□□□ -0.33
DNF3Q12674 CSM1YCR086W 573 nt12.97□□□□□ -0.33
DNF3Q12674 YER190C-AYER190C-A 576 nt12.97□□□□□ -0.33
DNF3Q12674 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt12.97□□□□□ -0.33
DNF3Q12674 YML133W-AYML133W-A 576 nt12.97□□□□□ -0.33
DNF3Q12674 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt12.97□□□□□ -0.33
DNF3Q12674 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt12.97□□□□□ -0.33
DNF3Q12674 YPR126CYPR126C 309 nt12.97□□□□□ -0.33
DNF3Q12674 YPL251WYPL251W 303 nt12.96□□□□□ -0.33
DNF3Q12674 NUC1YJL208C 990 nt12.96□□□□□ -0.34
DNF3Q12674 CDD1YLR245C 429 nt12.95□□□□□ -0.34
DNF3Q12674 SAM3YPL274W 1764 nt12.93□□□□□ -0.34
DNF3Q12674 RIB7YBR153W 735 nt12.93□□□□□ -0.34
DNF3Q12674 HOG1YLR113W 1308 nt12.92□□□□□ -0.34
DNF3Q12674 RPL12BYDR418W 498 nt12.92□□□□□ -0.34
DNF3Q12674 LYS20YDL182W 1287 nt12.91□□□□□ -0.34
DNF3Q12674 CTI6YPL181W 1521 nt12.9□□□□□ -0.34
DNF3Q12674 SWM1YDR260C 513 nt12.89□□□□□ -0.35
DNF3Q12674 PAC11YDR488C 1602 nt12.87□□□□□ -0.35
DNF3Q12674 IGD1YFR017C 588 nt12.86□□□□□ -0.35
DNF3Q12674 YOR343CYOR343C 327 nt12.86□□□□□ -0.35
DNF3Q12674 NIF3YGL221C 867 nt12.84□□□□□ -0.35
DNF3Q12674 LIP1YMR298W 453 nt12.83□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 PAU21YOR394W 495 nt12.82□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 PAU22YPL282C 495 nt12.82□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 RPT5YOR117W 1305 nt12.82□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 SSN3YPL042C 1668 nt12.81□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt12.8□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt12.8□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt12.8□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt12.8□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt12.8□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt12.8□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt12.8□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt12.8□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt12.8□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt12.8□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt12.8□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 TOS1YBR162C 1368 nt12.79□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 PRM5YIL117C 957 nt12.79□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 BNI5YNL166C 1347 nt12.78□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 SAM35YHR083W 990 nt12.78□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 HIF1YLL022C 1158 nt12.78□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 YMR103CYMR103C 363 nt12.78□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 YOR268CYOR268C 399 nt12.78□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 IRC24YIR036C 792 nt12.77□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 YMR007WYMR007W 381 nt12.77□□□□□ -0.36
DNF3Q12674 YKR005CYKR005C 1578 nt12.77□□□□□ -0.37
DNF3Q12674 IPL1YPL209C 1104 nt12.77□□□□□ -0.37
DNF3Q12674 YGR259CYGR259C 441 nt12.76□□□□□ -0.37
DNF3Q12674 NAS2YIL007C 663 nt12.76□□□□□ -0.37
DNF3Q12674 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt12.76□□□□□ -0.37
DNF3Q12674 YMR206WYMR206W 942 nt12.76□□□□□ -0.37
DNF3Q12674 OYE3YPL171C 1203 nt12.76□□□□□ -0.37
DNF3Q12674 YBL086CYBL086C 1401 nt12.75□□□□□ -0.37
DNF3Q12674 GRH1YDR517W 1119 nt12.74□□□□□ -0.37
DNF3Q12674 FLX1YIL134W 936 nt12.74□□□□□ -0.37
DNF3Q12674 DAK2YFL053W 1776 nt12.73□□□□□ -0.37
DNF3Q12674 PHO23YNL097C 993 nt12.73□□□□□ -0.37
DNF3Q12674 TPS1YBR126C 1488 nt12.69□□□□□ -0.38
DNF3Q12674 TOA2YKL058W 369 nt12.68□□□□□ -0.38
DNF3Q12674 KAE1YKR038C 1161 nt12.67□□□□□ -0.38
DNF3Q12674 OYE2YHR179W 1203 nt12.67□□□□□ -0.38
DNF3Q12674 PCP1YGR101W 1041 nt12.66□□□□□ -0.38
DNF3Q12674 RCR1YBR005W 642 nt12.65□□□□□ -0.38
DNF3Q12674 IML3YBR107C 738 nt12.64□□□□□ -0.39
DNF3Q12674 TGA1tA(UGC)A 73 nt12.63□□□□□ -0.39
DNF3Q12674 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt12.63□□□□□ -0.39
DNF3Q12674 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt12.63□□□□□ -0.39
DNF3Q12674 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt12.63□□□□□ -0.39
DNF3Q12674 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt12.63□□□□□ -0.39
DNF3Q12674 BRR1YPR057W 1026 nt12.63□□□□□ -0.39
DNF3Q12674 GND2YGR256W 1479 nt12.63□□□□□ -0.39
DNF3Q12674 FCY1YPR062W 477 nt12.61□□□□□ -0.39
DNF3Q12674 TRT2tT(CGU)K 72 nt12.61□□□□□ -0.39
DNF3Q12674 YNL024CYNL024C 741 nt12.6□□□□□ -0.39
DNF3Q12674 DDI1YER143W 1287 nt12.59□□□□□ -0.39
DNF3Q12674 HRA1HRA1 564 nt12.58□□□□□ -0.4
DNF3Q12674 EDC2YER035W 438 nt12.57□□□□□ -0.4
DNF3Q12674 SPE2YOL052C 1191 nt12.57□□□□□ -0.4
DNF3Q12674 MSC1YML128C 1542 nt12.56□□□□□ -0.4
DNF3Q12674 HXT1YHR094C 1713 nt12.56□□□□□ -0.4
DNF3Q12674 SAM2YDR502C 1155 nt12.54□□□□□ -0.4
DNF3Q12674 DBP1YPL119C 1854 nt12.54□□□□□ -0.4
DNF3Q12674 SER2YGR208W 930 nt12.53□□□□□ -0.4
DNF3Q12674 LEU9YOR108W 1815 nt12.52□□□□□ -0.4
DNF3Q12674 ADH3YMR083W 1128 nt12.52□□□□□ -0.4
DNF3Q12674 PHB2YGR231C 933 nt12.51□□□□□ -0.41
DNF3Q12674 DPS1YLL018C 1674 nt12.5□□□□□ -0.41
DNF3Q12674 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt12.49□□□□□ -0.41
DNF3Q12674 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt12.49□□□□□ -0.41
DNF3Q12674 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt12.49□□□□□ -0.41
DNF3Q12674 SUP51tL(UAA)J 84 nt12.49□□□□□ -0.41
DNF3Q12674 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt12.49□□□□□ -0.41
DNF3Q12674 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt12.49□□□□□ -0.41
DNF3Q12674 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt12.49□□□□□ -0.41
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