Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 URA6YKL024C 615 nt8.43□□□□□ -1.06
PRP46Q12417 PHO23YNL097C 993 nt8.43□□□□□ -1.06
PRP46Q12417 VRG4YGL225W 1014 nt8.42□□□□□ -1.06
PRP46Q12417 OXA1YER154W 1209 nt8.4□□□□□ -1.06
PRP46Q12417 YJL055WYJL055W 738 nt8.4□□□□□ -1.06
PRP46Q12417 GND2YGR256W 1479 nt8.39□□□□□ -1.07
PRP46Q12417 ADH7YCR105W 1086 nt8.39□□□□□ -1.07
PRP46Q12417 CYT2YKL087C 675 nt8.39□□□□□ -1.07
PRP46Q12417 MSC1YML128C 1542 nt8.38□□□□□ -1.07
PRP46Q12417 SEC61YLR378C 1443 nt8.37□□□□□ -1.07
PRP46Q12417 OYE3YPL171C 1203 nt8.37□□□□□ -1.07
PRP46Q12417 BNI5YNL166C 1347 nt8.36□□□□□ -1.07
PRP46Q12417 SAM3YPL274W 1764 nt8.36□□□□□ -1.07
PRP46Q12417 CPD1YGR247W 720 nt8.36□□□□□ -1.07
PRP46Q12417 YJL118WYJL118W 660 nt8.36□□□□□ -1.07
PRP46Q12417 LSB5YCL034W 1065 nt8.36□□□□□ -1.07
PRP46Q12417 CMP2YML057W 1815 nt8.35□□□□□ -1.07
PRP46Q12417 PAU15YIR041W 375 nt8.34□□□□□ -1.07
PRP46Q12417 GAL3YDR009W 1563 nt8.34□□□□□ -1.07
PRP46Q12417 CCT5YJR064W 1689 nt8.34□□□□□ -1.08
PRP46Q12417 YJL067WYJL067W 351 nt8.33□□□□□ -1.08
PRP46Q12417 NUC1YJL208C 990 nt8.33□□□□□ -1.08
PRP46Q12417 PET8YNL003C 855 nt8.33□□□□□ -1.08
PRP46Q12417 GPN2YOR262W 1044 nt8.33□□□□□ -1.08
PRP46Q12417 RPT5YOR117W 1305 nt8.32□□□□□ -1.08
PRP46Q12417 FUB1YCR076C 753 nt8.29□□□□□ -1.08
PRP46Q12417 SAM2YDR502C 1155 nt8.29□□□□□ -1.08
PRP46Q12417 YER188WYER188W 720 nt8.29□□□□□ -1.08
PRP46Q12417 RIB7YBR153W 735 nt8.29□□□□□ -1.08
PRP46Q12417 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.29□□□□□ -1.08
PRP46Q12417 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.29□□□□□ -1.08
PRP46Q12417 ESS1YJR017C 513 nt8.28□□□□□ -1.08
PRP46Q12417 GID7YCL039W 2238 nt8.27□□□□□ -1.08
PRP46Q12417 FLR1YBR008C 1647 nt8.26□□□□□ -1.09
PRP46Q12417 DLD2YDL178W 1593 nt8.25□□□□□ -1.09
PRP46Q12417 YPS3YLR121C 1527 nt8.24□□□□□ -1.09
PRP46Q12417 FMS1YMR020W 1527 nt8.24□□□□□ -1.09
PRP46Q12417 OYE2YHR179W 1203 nt8.23□□□□□ -1.09
PRP46Q12417 HSL7YBR133C 2484 nt8.23□□□□□ -1.09
PRP46Q12417 SNZ1YMR096W 894 nt8.22□□□□□ -1.09
PRP46Q12417 EAF3YPR023C 1206 nt8.22□□□□□ -1.09
PRP46Q12417 YPR126CYPR126C 309 nt8.22□□□□□ -1.09
PRP46Q12417 RSC8YFR037C 1674 nt8.21□□□□□ -1.09
PRP46Q12417 TPS1YBR126C 1488 nt8.2□□□□□ -1.1
PRP46Q12417 THI72YOR192C 1800 nt8.2□□□□□ -1.1
PRP46Q12417 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.2□□□□□ -1.1
PRP46Q12417 RAS2YNL098C 969 nt8.2□□□□□ -1.1
PRP46Q12417 PGC1YPL206C 966 nt8.2□□□□□ -1.1
PRP46Q12417 HEM13YDR044W 987 nt8.19□□□□□ -1.1
PRP46Q12417 DAK2YFL053W 1776 nt8.19□□□□□ -1.1
PRP46Q12417 ACH1YBL015W 1581 nt8.18□□□□□ -1.1
PRP46Q12417 YBR232CYBR232C 360 nt8.18□□□□□ -1.1
PRP46Q12417 TAF13YML098W 504 nt8.17□□□□□ -1.1
PRP46Q12417 YAT1YAR035W 2064 nt8.17□□□□□ -1.1
PRP46Q12417 OSH7YHR001W 1314 nt8.16□□□□□ -1.1
PRP46Q12417 MHF1YOL086W-A 273 nt8.16□□□□□ -1.1
PRP46Q12417 SPP2YOR148C 558 nt8.16□□□□□ -1.1
PRP46Q12417 ESBP6YNL125C 2022 nt8.15□□□□□ -1.1
PRP46Q12417 CWC15YDR163W 528 nt8.15□□□□□ -1.1
PRP46Q12417 TMA23YMR269W 636 nt8.15□□□□□ -1.1
PRP46Q12417 STP3YLR375W 1032 nt8.14□□□□□ -1.11
PRP46Q12417 PAU5YFL020C 369 nt8.13□□□□□ -1.11
PRP46Q12417 INA1YLR413W 2028 nt8.12□□□□□ -1.11
PRP46Q12417 SOL2YCR073W-A 948 nt8.11□□□□□ -1.11
PRP46Q12417 CTI6YPL181W 1521 nt8.1□□□□□ -1.11
PRP46Q12417 YMR262WYMR262W 942 nt8.1□□□□□ -1.11
PRP46Q12417 IML3YBR107C 738 nt8.1□□□□□ -1.11
PRP46Q12417 RPC82YPR190C 1965 nt8.1□□□□□ -1.11
PRP46Q12417 HEL2YDR266C 1920 nt8.09□□□□□ -1.11
PRP46Q12417 IMO32YGR031W 1029 nt8.09□□□□□ -1.11
PRP46Q12417 POT1YIL160C 1254 nt8.09□□□□□ -1.11
PRP46Q12417 TAT2YOL020W 1779 nt8.09□□□□□ -1.11
PRP46Q12417 DDI1YER143W 1287 nt8.08□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 SEN2YLR105C 1134 nt8.08□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 GSF2YML048W 1212 nt8.08□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 YNL024CYNL024C 741 nt8.08□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 RRT8YOL048C 1029 nt8.08□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 VPS62YGR141W 1404 nt8.07□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 TUB4YLR212C 1422 nt8.07□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 YDR455CYDR455C 309 nt8.07□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 NAP1YKR048C 1254 nt8.07□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.06□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.05□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 YDL086WYDL086W 822 nt8.04□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 NIF3YGL221C 867 nt8.04□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 MCM5YLR274W 2328 nt8.04□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 ILV3YJR016C 1758 nt8.04□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 HEM14YER014W 1620 nt8.03□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 PAR32YDL173W 888 nt8.03□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 LSM5YER146W 282 nt8.03□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 OPI10YOL032W 741 nt8.03□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 PUP1YOR157C 786 nt8.03□□□□□ -1.12
PRP46Q12417 APS2YJR058C 444 nt8.02□□□□□ -1.13
PRP46Q12417 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.02□□□□□ -1.13
PRP46Q12417 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.02□□□□□ -1.13
PRP46Q12417 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.02□□□□□ -1.13
PRP46Q12417 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.02□□□□□ -1.13
PRP46Q12417 SPS100YHR139C 981 nt8.01□□□□□ -1.13
PRP46Q12417 DTR1YBR180W 1719 nt8□□□□□ -1.13
PRP46Q12417 MAS1YLR163C 1389 nt8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.3 ms