Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 HXT10YFL011W 1641 nt8.35□□□□□ -1.07
RTR2Q12378 YBL086CYBL086C 1401 nt8.35□□□□□ -1.07
RTR2Q12378 SSL2YIL143C 2532 nt8.35□□□□□ -1.07
RTR2Q12378 MDM35YKL053C-A 261 nt8.34□□□□□ -1.07
RTR2Q12378 GID8YMR135C 1368 nt8.34□□□□□ -1.07
RTR2Q12378 HEM14YER014W 1620 nt8.33□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 CLB6YGR109C 1143 nt8.33□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 MDL2YPL270W 2322 nt8.32□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 ATG15YCR068W 1563 nt8.32□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 Q0182Q0182 405 nt8.32□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 SHH4YLR164W 507 nt8.32□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 YLR111WYLR111W 333 nt8.31□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 LIP1YMR298W 453 nt8.31□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 PET8YNL003C 855 nt8.31□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 ZTA1YBR046C 1005 nt8.31□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 DIG1YPL049C 1359 nt8.31□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 RPS14BYJL191W 417 nt8.3□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 UFO1YML088W 2007 nt8.3□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 MRS6YOR370C 1812 nt8.29□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 TPN1YGL186C 1740 nt8.29□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 NBA1YOL070C 1506 nt8.29□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 YKL133CYKL133C 1392 nt8.28□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 UTH1YKR042W 1098 nt8.28□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 POM34YLR018C 900 nt8.28□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 PHO23YNL097C 993 nt8.28□□□□□ -1.08
RTR2Q12378 YML089CYML089C 369 nt8.27□□□□□ -1.09
RTR2Q12378 TOM6YOR045W 186 nt8.27□□□□□ -1.09
RTR2Q12378 SPP2YOR148C 558 nt8.27□□□□□ -1.09
RTR2Q12378 OYE3YPL171C 1203 nt8.27□□□□□ -1.09
RTR2Q12378 VPS62YGR141W 1404 nt8.27□□□□□ -1.09
RTR2Q12378 ACH1YBL015W 1581 nt8.27□□□□□ -1.09
RTR2Q12378 SAM1YLR180W 1149 nt8.26□□□□□ -1.09
RTR2Q12378 SDH5YOL071W 489 nt8.26□□□□□ -1.09
RTR2Q12378 HIP1YGR191W 1812 nt8.26□□□□□ -1.09
RTR2Q12378 YDL086WYDL086W 822 nt8.25□□□□□ -1.09
RTR2Q12378 RAD23YEL037C 1197 nt8.25□□□□□ -1.09
RTR2Q12378 TOM71YHR117W 1920 nt8.24□□□□□ -1.09
RTR2Q12378 SED1YDR077W 1017 nt8.23□□□□□ -1.09
RTR2Q12378 PEX2YJL210W 816 nt8.23□□□□□ -1.09
RTR2Q12378 LSR1LSR1 1175 nt8.23□□□□□ -1.09
RTR2Q12378 TSC10YBR265W 963 nt8.22□□□□□ -1.09
RTR2Q12378 LEU9YOR108W 1815 nt8.22□□□□□ -1.09
RTR2Q12378 FRA1YLL029W 2250 nt8.21□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 FMS1YMR020W 1527 nt8.21□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.21□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.21□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 CWP2YKL096W-A 279 nt8.21□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.21□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.21□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.21□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 AGP3YFL055W 1677 nt8.21□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 TOA2YKL058W 369 nt8.2□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 MET28YIR017C 564 nt8.19□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.19□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 TIF6YPR016C 738 nt8.19□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 YGR012WYGR012W 1182 nt8.18□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 YHR219WYHR219W 1875 nt8.17□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 TIM44YIL022W 1296 nt8.17□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 MIM1YOL026C 342 nt8.17□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 DAK2YFL053W 1776 nt8.17□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 RIB3YDR487C 627 nt8.16□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 UFD1YGR048W 1086 nt8.16□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 BRR1YPR057W 1026 nt8.16□□□□□ -1.1
RTR2Q12378 GND2YGR256W 1479 nt8.14□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.14□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.14□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.14□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.14□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.14□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.14□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.14□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.14□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.14□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.14□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.14□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.14□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.14□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.14□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.14□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 LSB5YCL034W 1065 nt8.14□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 CAB5YDR196C 726 nt8.13□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.13□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 YAR028WYAR028W 705 nt8.13□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 FIT3YOR383C 615 nt8.13□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 YPS3YLR121C 1527 nt8.13□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 YLR279WYLR279W 390 nt8.12□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 FIT1YDR534C 1587 nt8.11□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 RPD3YNL330C 1302 nt8.1□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 ALR1YOL130W 2580 nt8.1□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 SFL1YOR140W 2301 nt8.1□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 LPD1YFL018C 1500 nt8.09□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 HBS1YKR084C 1836 nt8.09□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 SAM2YDR502C 1155 nt8.09□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 YMR262WYMR262W 942 nt8.09□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 NSG2YNL156C 900 nt8.09□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 YPL251WYPL251W 303 nt8.09□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 FLR1YBR008C 1647 nt8.09□□□□□ -1.11
RTR2Q12378 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.07□□□□□ -1.12
RTR2Q12378 MSB4YOL112W 1479 nt8.06□□□□□ -1.12
RTR2Q12378 MTG2YHR168W 1557 nt8.05□□□□□ -1.12
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