Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gdf9Q07105 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gdf9Q07105 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf9Q07105 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gdf9Q07105 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gdf9Q07105 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gdf9Q07105 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdf9Q07105 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms