Protein–RNA interactions for Protein: Q04201

CUE4, CUE domain-containing protein CUE4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE4Q04201 SHH4YLR164W 507 nt7.45□□□□□ -1.22
CUE4Q04201 FMS1YMR020W 1527 nt7.45□□□□□ -1.22
CUE4Q04201 BDH1YAL060W 1149 nt7.44□□□□□ -1.22
CUE4Q04201 SAM1YLR180W 1149 nt7.44□□□□□ -1.22
CUE4Q04201 POM34YLR018C 900 nt7.43□□□□□ -1.22
CUE4Q04201 HBS1YKR084C 1836 nt7.43□□□□□ -1.22
CUE4Q04201 YER190C-AYER190C-A 576 nt7.42□□□□□ -1.22
CUE4Q04201 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt7.42□□□□□ -1.22
CUE4Q04201 YML133W-AYML133W-A 576 nt7.42□□□□□ -1.22
CUE4Q04201 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt7.42□□□□□ -1.22
CUE4Q04201 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt7.42□□□□□ -1.22
CUE4Q04201 LEU9YOR108W 1815 nt7.41□□□□□ -1.22
CUE4Q04201 SED1YDR077W 1017 nt7.41□□□□□ -1.22
CUE4Q04201 TOA2YKL058W 369 nt7.41□□□□□ -1.22
CUE4Q04201 TOM71YHR117W 1920 nt7.4□□□□□ -1.22
CUE4Q04201 RPD3YNL330C 1302 nt7.38□□□□□ -1.23
CUE4Q04201 YKL030WYKL030W 606 nt7.38□□□□□ -1.23
CUE4Q04201 YMR262WYMR262W 942 nt7.38□□□□□ -1.23
CUE4Q04201 YML089CYML089C 369 nt7.37□□□□□ -1.23
CUE4Q04201 BRR1YPR057W 1026 nt7.37□□□□□ -1.23
CUE4Q04201 GND2YGR256W 1479 nt7.36□□□□□ -1.23
CUE4Q04201 LSM5YER146W 282 nt7.36□□□□□ -1.23
CUE4Q04201 DUR3YHL016C 2208 nt7.36□□□□□ -1.23
CUE4Q04201 YPS3YLR121C 1527 nt7.36□□□□□ -1.23
CUE4Q04201 UBX6YJL048C 1191 nt7.35□□□□□ -1.23
CUE4Q04201 DUS3YLR401C 2007 nt7.35□□□□□ -1.23
CUE4Q04201 FET5YFL041W 1869 nt7.34□□□□□ -1.23
CUE4Q04201 ALR1YOL130W 2580 nt7.34□□□□□ -1.23
CUE4Q04201 INH1YDL181W 258 nt7.34□□□□□ -1.23
CUE4Q04201 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.34□□□□□ -1.23
CUE4Q04201 FLR1YBR008C 1647 nt7.33□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 MET30YIL046W 1923 nt7.33□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 POP2YNR052C 1302 nt7.32□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 SAM2YDR502C 1155 nt7.32□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 UTH1YKR042W 1098 nt7.31□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 YAR028WYAR028W 705 nt7.31□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 YPL251WYPL251W 303 nt7.31□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 DLD3YEL071W 1491 nt7.3□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 YNL190WYNL190W 615 nt7.3□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 ORT1YOR130C 879 nt7.3□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 RIM2YBR192W 1134 nt7.3□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt7.28□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 IMT4tM(CAU)E 72 nt7.28□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 IMT3tM(CAU)J3 72 nt7.28□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 IMT1tM(CAU)O1 72 nt7.28□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 IMT2tM(CAU)P 72 nt7.28□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 snR4snR4 186 nt7.28□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 SFL1YOR140W 2301 nt7.28□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 ADE16YLR028C 1776 nt7.28□□□□□ -1.24
CUE4Q04201 HIP1YGR191W 1812 nt7.27□□□□□ -1.25
CUE4Q04201 RPC31YNL151C 756 nt7.27□□□□□ -1.25
CUE4Q04201 YLR046CYLR046C 813 nt7.26□□□□□ -1.25
CUE4Q04201 YSP3YOR003W 1437 nt7.26□□□□□ -1.25
CUE4Q04201 LEU4YNL104C 1860 nt7.26□□□□□ -1.25
CUE4Q04201 DLD2YDL178W 1593 nt7.25□□□□□ -1.25
CUE4Q04201 TOM6YOR045W 186 nt7.25□□□□□ -1.25
CUE4Q04201 MSF1YPR047W 1410 nt7.25□□□□□ -1.25
CUE4Q04201 HXT12YIL170W 1374 nt7.24□□□□□ -1.25
CUE4Q04201 MTG2YHR168W 1557 nt7.24□□□□□ -1.25
CUE4Q04201 DPL1YDR294C 1770 nt7.23□□□□□ -1.25
CUE4Q04201 AIM1YAL046C 357 nt7.23□□□□□ -1.25
CUE4Q04201 NPP2YEL016C 1482 nt7.23□□□□□ -1.25
CUE4Q04201 HEM13YDR044W 987 nt7.22□□□□□ -1.25
CUE4Q04201 LAS17YOR181W 1902 nt7.22□□□□□ -1.25
CUE4Q04201 KRR1YCL059C 951 nt7.21□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 YMR103CYMR103C 363 nt7.21□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 TIF6YPR016C 738 nt7.21□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 PFS2YNL317W 1398 nt7.2□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 VMA11YPL234C 495 nt7.2□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 TRP2YER090W 1524 nt7.2□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 SEC61YLR378C 1443 nt7.19□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 BSP1YPR171W 1731 nt7.19□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 ENT4YLL038C 744 nt7.19□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 SPP1YPL138C 1062 nt7.19□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 TIP1YBR067C 633 nt7.19□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 FRE6YLL051C 2139 nt7.19□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt7.18□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 PRE6YOL038W 765 nt7.18□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 ITR2YOL103W 1830 nt7.17□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 HXT11YOL156W 1704 nt7.17□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 HSV2YGR223C 1347 nt7.17□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 AKR2YOR034C 2250 nt7.17□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 OXA1YER154W 1209 nt7.16□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 FRA1YLL029W 2250 nt7.16□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 THI6YPL214C 1623 nt7.16□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 AIM34YMR003W 597 nt7.15□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 NSG2YNL156C 900 nt7.15□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 SNX3YOR357C 489 nt7.15□□□□□ -1.26
CUE4Q04201 SFA1YDL168W 1161 nt7.14□□□□□ -1.27
CUE4Q04201 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.14□□□□□ -1.27
CUE4Q04201 PEX2YJL210W 816 nt7.14□□□□□ -1.27
CUE4Q04201 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.14□□□□□ -1.27
CUE4Q04201 ALP1YNL270C 1722 nt7.14□□□□□ -1.27
CUE4Q04201 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.14□□□□□ -1.27
CUE4Q04201 SRM1YGL097W 1449 nt7.12□□□□□ -1.27
CUE4Q04201 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.12□□□□□ -1.27
CUE4Q04201 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.12□□□□□ -1.27
CUE4Q04201 YDR467CYDR467C 327 nt7.12□□□□□ -1.27
CUE4Q04201 HEM14YER014W 1620 nt7.1□□□□□ -1.27
CUE4Q04201 YNL115CYNL115C 1935 nt7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms