Protein–RNA interactions for Protein: Q03280

TOM1, E3 ubiquitin-protein ligase TOM1, yeastyeast

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Length 3,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOM1Q03280 SAM3YPL274W 1764 nt10.53□□□□□ -0.72
TOM1Q03280 YMR210WYMR210W 1350 nt10.53□□□□□ -0.72
TOM1Q03280 AQY2YLL052C 450 nt10.52□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 YJL118WYJL118W 660 nt10.52□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 GRH1YDR517W 1119 nt10.51□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 PCP1YGR101W 1041 nt10.5□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 IPL1YPL209C 1104 nt10.5□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 MHF1YOL086W-A 273 nt10.49□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 YAR028WYAR028W 705 nt10.48□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 LYS20YDL182W 1287 nt10.48□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 PRE5YMR314W 705 nt10.48□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 DIF1YLR437C 402 nt10.47□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt10.47□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt10.47□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt10.47□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt10.47□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt10.47□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt10.47□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt10.47□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt10.47□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt10.47□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt10.47□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt10.47□□□□□ -0.73
TOM1Q03280 YPR126CYPR126C 309 nt10.46□□□□□ -0.74
TOM1Q03280 PCH2YBR186W 1695 nt10.46□□□□□ -0.74
TOM1Q03280 TGA1tA(UGC)A 73 nt10.45□□□□□ -0.74
TOM1Q03280 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt10.45□□□□□ -0.74
TOM1Q03280 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt10.45□□□□□ -0.74
TOM1Q03280 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt10.45□□□□□ -0.74
TOM1Q03280 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt10.45□□□□□ -0.74
TOM1Q03280 SDH8YBR269C 417 nt10.45□□□□□ -0.74
TOM1Q03280 YFL054CYFL054C 1941 nt10.44□□□□□ -0.74
TOM1Q03280 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.41□□□□□ -0.74
TOM1Q03280 SPG1YGR236C 288 nt10.4□□□□□ -0.74
TOM1Q03280 AKR2YOR034C 2250 nt10.39□□□□□ -0.75
TOM1Q03280 HRA1HRA1 564 nt10.39□□□□□ -0.75
TOM1Q03280 HIF1YLL022C 1158 nt10.38□□□□□ -0.75
TOM1Q03280 CDD1YLR245C 429 nt10.38□□□□□ -0.75
TOM1Q03280 ASP3-1YLR155C 1089 nt10.38□□□□□ -0.75
TOM1Q03280 ASP3-2YLR157C 1089 nt10.38□□□□□ -0.75
TOM1Q03280 ASP3-3YLR158C 1089 nt10.38□□□□□ -0.75
TOM1Q03280 ASP3-4YLR160C 1089 nt10.38□□□□□ -0.75
TOM1Q03280 OYE3YPL171C 1203 nt10.38□□□□□ -0.75
TOM1Q03280 ARP6YLR085C 1317 nt10.35□□□□□ -0.75
TOM1Q03280 BAP3YDR046C 1815 nt10.35□□□□□ -0.75
TOM1Q03280 STR3YGL184C 1398 nt10.35□□□□□ -0.75
TOM1Q03280 BOP3YNL042W 1191 nt10.32□□□□□ -0.76
TOM1Q03280 RCR1YBR005W 642 nt10.32□□□□□ -0.76
TOM1Q03280 NAS2YIL007C 663 nt10.31□□□□□ -0.76
TOM1Q03280 NUC1YJL208C 990 nt10.3□□□□□ -0.76
TOM1Q03280 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.29□□□□□ -0.76
TOM1Q03280 NIF3YGL221C 867 nt10.29□□□□□ -0.76
TOM1Q03280 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.29□□□□□ -0.76
TOM1Q03280 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.29□□□□□ -0.76
TOM1Q03280 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.29□□□□□ -0.76
TOM1Q03280 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.29□□□□□ -0.76
TOM1Q03280 SSN3YPL042C 1668 nt10.29□□□□□ -0.76
TOM1Q03280 FLX1YIL134W 936 nt10.29□□□□□ -0.76
TOM1Q03280 UTR1YJR049C 1593 nt10.27□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt10.26□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt10.26□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt10.26□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 SUP51tL(UAA)J 84 nt10.26□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt10.26□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt10.26□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt10.26□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 MOB1YIL106W 945 nt10.26□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 SPE2YOL052C 1191 nt10.25□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 SED1YDR077W 1017 nt10.24□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 DUS1YML080W 1272 nt10.24□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 SWE1YJL187C 2460 nt10.24□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 YPL251WYPL251W 303 nt10.24□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 FCY1YPR062W 477 nt10.24□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 EDC2YER035W 438 nt10.23□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 ADH3YMR083W 1128 nt10.23□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 TPS1YBR126C 1488 nt10.21□□□□□ -0.77
TOM1Q03280 RIB7YBR153W 735 nt10.2□□□□□ -0.78
TOM1Q03280 RSC8YFR037C 1674 nt10.2□□□□□ -0.78
TOM1Q03280 CSM1YCR086W 573 nt10.2□□□□□ -0.78
TOM1Q03280 COS10YNR075W 1125 nt10.2□□□□□ -0.78
TOM1Q03280 DAK2YFL053W 1776 nt10.2□□□□□ -0.78
TOM1Q03280 MEP3YPR138C 1470 nt10.19□□□□□ -0.78
TOM1Q03280 DBP1YPL119C 1854 nt10.19□□□□□ -0.78
TOM1Q03280 YBL086CYBL086C 1401 nt10.19□□□□□ -0.78
TOM1Q03280 EMC3YKL207W 762 nt10.18□□□□□ -0.78
TOM1Q03280 PHB2YGR231C 933 nt10.17□□□□□ -0.78
TOM1Q03280 RPT5YOR117W 1305 nt10.17□□□□□ -0.78
TOM1Q03280 MSC1YML128C 1542 nt10.14□□□□□ -0.79
TOM1Q03280 AVO2YMR068W 1281 nt10.13□□□□□ -0.79
TOM1Q03280 BNI5YNL166C 1347 nt10.13□□□□□ -0.79
TOM1Q03280 ELP4YPL101W 1371 nt10.12□□□□□ -0.79
TOM1Q03280 HTS1YPR033C 1641 nt10.12□□□□□ -0.79
TOM1Q03280 YGR259CYGR259C 441 nt10.09□□□□□ -0.79
TOM1Q03280 IML3YBR107C 738 nt10.09□□□□□ -0.79
TOM1Q03280 IRC24YIR036C 792 nt10.09□□□□□ -0.79
TOM1Q03280 DDI1YER143W 1287 nt10.08□□□□□ -0.8
TOM1Q03280 RTN2YDL204W 1182 nt10.08□□□□□ -0.8
TOM1Q03280 THP3YPR045C 1413 nt10.07□□□□□ -0.8
TOM1Q03280 CYC3YAL039C 810 nt10.07□□□□□ -0.8
TOM1Q03280 YMR103CYMR103C 363 nt10.07□□□□□ -0.8
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