Protein–RNA interactions for Protein: P82663

MRPS25, 28S ribosomal protein S25, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS25P82663 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MRPS25P82663 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MRPS25P82663 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MRPS25P82663 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MRPS25P82663 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MRPS25P82663 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MRPS25P82663 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MRPS25P82663 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MRPS25P82663 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MRPS25P82663 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MRPS25P82663 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MRPS25P82663 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MRPS25P82663 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRPS25P82663 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MRPS25P82663 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRPS25P82663 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRPS25P82663 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRPS25P82663 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRPS25P82663 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRPS25P82663 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MRPS25P82663 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MRPS25P82663 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MRPS25P82663 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MRPS25P82663 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MRPS25P82663 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MRPS25P82663 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MRPS25P82663 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRPS25P82663 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRPS25P82663 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRPS25P82663 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPS25P82663 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPS25P82663 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MRPS25P82663 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MRPS25P82663 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MRPS25P82663 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MRPS25P82663 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MRPS25P82663 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MRPS25P82663 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRPS25P82663 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRPS25P82663 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRPS25P82663 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRPS25P82663 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRPS25P82663 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRPS25P82663 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPS25P82663 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPS25P82663 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPS25P82663 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPS25P82663 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPS25P82663 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPS25P82663 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MRPS25P82663 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRPS25P82663 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRPS25P82663 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRPS25P82663 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRPS25P82663 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MRPS25P82663 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPS25P82663 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPS25P82663 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPS25P82663 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPS25P82663 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPS25P82663 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPS25P82663 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MRPS25P82663 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MRPS25P82663 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MRPS25P82663 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MRPS25P82663 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MRPS25P82663 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MRPS25P82663 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MRPS25P82663 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MRPS25P82663 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
MRPS25P82663 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MRPS25P82663 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MRPS25P82663 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MRPS25P82663 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MRPS25P82663 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MRPS25P82663 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MRPS25P82663 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MRPS25P82663 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MRPS25P82663 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MRPS25P82663 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MRPS25P82663 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MRPS25P82663 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MRPS25P82663 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MRPS25P82663 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MRPS25P82663 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MRPS25P82663 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MRPS25P82663 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRPS25P82663 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRPS25P82663 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRPS25P82663 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRPS25P82663 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRPS25P82663 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRPS25P82663 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MRPS25P82663 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MRPS25P82663 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MRPS25P82663 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRPS25P82663 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRPS25P82663 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRPS25P82663 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRPS25P82663 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms