Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GTF2IP78347 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GTF2IP78347 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GTF2IP78347 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GTF2IP78347 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GTF2IP78347 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GTF2IP78347 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GTF2IP78347 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GTF2IP78347 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GTF2IP78347 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GTF2IP78347 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GTF2IP78347 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
GTF2IP78347 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GTF2IP78347 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GTF2IP78347 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GTF2IP78347 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GTF2IP78347 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GTF2IP78347 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
GTF2IP78347 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GTF2IP78347 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GTF2IP78347 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GTF2IP78347 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GTF2IP78347 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GTF2IP78347 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GTF2IP78347 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GTF2IP78347 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GTF2IP78347 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GTF2IP78347 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GTF2IP78347 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GTF2IP78347 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GTF2IP78347 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GTF2IP78347 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GTF2IP78347 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GTF2IP78347 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GTF2IP78347 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GTF2IP78347 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GTF2IP78347 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GTF2IP78347 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GTF2IP78347 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GTF2IP78347 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GTF2IP78347 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GTF2IP78347 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GTF2IP78347 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GTF2IP78347 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GTF2IP78347 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GTF2IP78347 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GTF2IP78347 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GTF2IP78347 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GTF2IP78347 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GTF2IP78347 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
GTF2IP78347 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GTF2IP78347 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GTF2IP78347 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GTF2IP78347 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
GTF2IP78347 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GTF2IP78347 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GTF2IP78347 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GTF2IP78347 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GTF2IP78347 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
GTF2IP78347 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GTF2IP78347 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GTF2IP78347 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GTF2IP78347 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GTF2IP78347 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
GTF2IP78347 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GTF2IP78347 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GTF2IP78347 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GTF2IP78347 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GTF2IP78347 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GTF2IP78347 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
GTF2IP78347 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
GTF2IP78347 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
GTF2IP78347 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GTF2IP78347 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
GTF2IP78347 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GTF2IP78347 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GTF2IP78347 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GTF2IP78347 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GTF2IP78347 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GTF2IP78347 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GTF2IP78347 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GTF2IP78347 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GTF2IP78347 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GTF2IP78347 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
GTF2IP78347 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GTF2IP78347 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GTF2IP78347 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GTF2IP78347 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GTF2IP78347 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GTF2IP78347 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GTF2IP78347 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GTF2IP78347 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GTF2IP78347 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GTF2IP78347 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GTF2IP78347 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GTF2IP78347 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GTF2IP78347 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GTF2IP78347 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GTF2IP78347 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GTF2IP78347 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms