Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM258P61165 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM258P61165 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM258P61165 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM258P61165 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM258P61165 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM258P61165 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM258P61165 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM258P61165 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM258P61165 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM258P61165 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM258P61165 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM258P61165 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM258P61165 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM258P61165 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM258P61165 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM258P61165 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM258P61165 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM258P61165 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM258P61165 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM258P61165 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM258P61165 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms