Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB2AP61019 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB2AP61019 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB2AP61019 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB2AP61019 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB2AP61019 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB2AP61019 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB2AP61019 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB2AP61019 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB2AP61019 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB2AP61019 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB2AP61019 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB2AP61019 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB2AP61019 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB2AP61019 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB2AP61019 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB2AP61019 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB2AP61019 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB2AP61019 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB2AP61019 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB2AP61019 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB2AP61019 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB2AP61019 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB2AP61019 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB2AP61019 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB2AP61019 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB2AP61019 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB2AP61019 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB2AP61019 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB2AP61019 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB2AP61019 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB2AP61019 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB2AP61019 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB2AP61019 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB2AP61019 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB2AP61019 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB2AP61019 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB2AP61019 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB2AP61019 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB2AP61019 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB2AP61019 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB2AP61019 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB2AP61019 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB2AP61019 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB2AP61019 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB2AP61019 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB2AP61019 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB2AP61019 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB2AP61019 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB2AP61019 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB2AP61019 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB2AP61019 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB2AP61019 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB2AP61019 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB2AP61019 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB2AP61019 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB2AP61019 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB2AP61019 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB2AP61019 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB2AP61019 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB2AP61019 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB2AP61019 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms