Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3BP58499 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3BP58499 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3BP58499 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3BP58499 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3BP58499 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3BP58499 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3BP58499 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3BP58499 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3BP58499 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3BP58499 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3BP58499 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3BP58499 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3BP58499 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3BP58499 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3BP58499 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3BP58499 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3BP58499 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3BP58499 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3BP58499 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3BP58499 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3BP58499 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM3BP58499 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM3BP58499 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3BP58499 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms