Protein–RNA interactions for Protein: P57073

SOX8, Transcription factor SOX-8, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX8P57073 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX8P57073 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX8P57073 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX8P57073 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX8P57073 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX8P57073 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX8P57073 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX8P57073 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX8P57073 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX8P57073 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX8P57073 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX8P57073 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX8P57073 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX8P57073 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX8P57073 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX8P57073 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX8P57073 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX8P57073 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX8P57073 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX8P57073 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX8P57073 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX8P57073 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX8P57073 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX8P57073 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX8P57073 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX8P57073 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX8P57073 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX8P57073 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX8P57073 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX8P57073 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX8P57073 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX8P57073 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX8P57073 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX8P57073 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX8P57073 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX8P57073 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX8P57073 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX8P57073 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX8P57073 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX8P57073 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX8P57073 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX8P57073 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX8P57073 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX8P57073 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX8P57073 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX8P57073 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOX8P57073 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX8P57073 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX8P57073 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX8P57073 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX8P57073 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX8P57073 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX8P57073 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX8P57073 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SOX8P57073 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX8P57073 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX8P57073 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX8P57073 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX8P57073 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX8P57073 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX8P57073 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX8P57073 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX8P57073 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX8P57073 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX8P57073 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX8P57073 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX8P57073 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX8P57073 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX8P57073 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX8P57073 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX8P57073 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX8P57073 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX8P57073 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX8P57073 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX8P57073 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX8P57073 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX8P57073 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX8P57073 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX8P57073 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX8P57073 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX8P57073 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX8P57073 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX8P57073 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX8P57073 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX8P57073 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX8P57073 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX8P57073 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX8P57073 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX8P57073 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX8P57073 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX8P57073 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX8P57073 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX8P57073 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX8P57073 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX8P57073 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX8P57073 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX8P57073 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SOX8P57073 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX8P57073 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX8P57073 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms