Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LAMB2P55268 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LAMB2P55268 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LAMB2P55268 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
LAMB2P55268 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LAMB2P55268 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LAMB2P55268 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LAMB2P55268 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LAMB2P55268 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LAMB2P55268 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LAMB2P55268 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LAMB2P55268 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMB2P55268 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMB2P55268 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMB2P55268 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMB2P55268 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMB2P55268 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMB2P55268 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
LAMB2P55268 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
LAMB2P55268 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LAMB2P55268 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LAMB2P55268 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMB2P55268 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMB2P55268 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMB2P55268 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMB2P55268 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMB2P55268 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMB2P55268 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LAMB2P55268 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LAMB2P55268 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LAMB2P55268 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LAMB2P55268 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LAMB2P55268 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LAMB2P55268 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
LAMB2P55268 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LAMB2P55268 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LAMB2P55268 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LAMB2P55268 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LAMB2P55268 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
LAMB2P55268 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
LAMB2P55268 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LAMB2P55268 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LAMB2P55268 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LAMB2P55268 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LAMB2P55268 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LAMB2P55268 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LAMB2P55268 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LAMB2P55268 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMB2P55268 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMB2P55268 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMB2P55268 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMB2P55268 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMB2P55268 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMB2P55268 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMB2P55268 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMB2P55268 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMB2P55268 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMB2P55268 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMB2P55268 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LAMB2P55268 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
LAMB2P55268 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
LAMB2P55268 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
LAMB2P55268 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LAMB2P55268 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LAMB2P55268 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LAMB2P55268 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LAMB2P55268 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMB2P55268 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMB2P55268 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMB2P55268 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMB2P55268 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMB2P55268 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LAMB2P55268 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LAMB2P55268 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LAMB2P55268 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LAMB2P55268 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LAMB2P55268 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMB2P55268 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LAMB2P55268 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LAMB2P55268 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LAMB2P55268 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
LAMB2P55268 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
LAMB2P55268 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms