Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CACNB3P54284 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CACNB3P54284 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CACNB3P54284 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CACNB3P54284 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CACNB3P54284 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CACNB3P54284 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CACNB3P54284 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CACNB3P54284 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CACNB3P54284 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CACNB3P54284 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CACNB3P54284 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CACNB3P54284 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CACNB3P54284 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CACNB3P54284 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CACNB3P54284 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CACNB3P54284 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CACNB3P54284 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CACNB3P54284 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CACNB3P54284 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CACNB3P54284 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CACNB3P54284 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CACNB3P54284 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CACNB3P54284 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CACNB3P54284 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CACNB3P54284 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CACNB3P54284 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CACNB3P54284 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CACNB3P54284 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CACNB3P54284 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CACNB3P54284 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CACNB3P54284 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CACNB3P54284 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CACNB3P54284 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CACNB3P54284 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CACNB3P54284 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CACNB3P54284 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CACNB3P54284 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CACNB3P54284 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CACNB3P54284 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CACNB3P54284 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CACNB3P54284 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CACNB3P54284 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CACNB3P54284 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CACNB3P54284 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CACNB3P54284 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
CACNB3P54284 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CACNB3P54284 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CACNB3P54284 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
CACNB3P54284 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
CACNB3P54284 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
CACNB3P54284 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CACNB3P54284 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CACNB3P54284 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
CACNB3P54284 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
CACNB3P54284 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CACNB3P54284 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CACNB3P54284 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
CACNB3P54284 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
CACNB3P54284 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
CACNB3P54284 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CACNB3P54284 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CACNB3P54284 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CACNB3P54284 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CACNB3P54284 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CACNB3P54284 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CACNB3P54284 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CACNB3P54284 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CACNB3P54284 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CACNB3P54284 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CACNB3P54284 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CACNB3P54284 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CACNB3P54284 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CACNB3P54284 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CACNB3P54284 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CACNB3P54284 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CACNB3P54284 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CACNB3P54284 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CACNB3P54284 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CACNB3P54284 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CACNB3P54284 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CACNB3P54284 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms