Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP2S1P53680 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP2S1P53680 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP2S1P53680 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP2S1P53680 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP2S1P53680 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP2S1P53680 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP2S1P53680 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP2S1P53680 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP2S1P53680 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP2S1P53680 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP2S1P53680 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP2S1P53680 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2S1P53680 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP2S1P53680 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AP2S1P53680 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP2S1P53680 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2S1P53680 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2S1P53680 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2S1P53680 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP2S1P53680 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP2S1P53680 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP2S1P53680 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP2S1P53680 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP2S1P53680 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP2S1P53680 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AP2S1P53680 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP2S1P53680 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP2S1P53680 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AP2S1P53680 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms