Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LIMK1P53667 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LIMK1P53667 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LIMK1P53667 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LIMK1P53667 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIMK1P53667 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LIMK1P53667 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LIMK1P53667 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIMK1P53667 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIMK1P53667 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LIMK1P53667 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIMK1P53667 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LIMK1P53667 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LIMK1P53667 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LIMK1P53667 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIMK1P53667 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIMK1P53667 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIMK1P53667 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIMK1P53667 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LIMK1P53667 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LIMK1P53667 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LIMK1P53667 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIMK1P53667 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIMK1P53667 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIMK1P53667 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIMK1P53667 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIMK1P53667 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIMK1P53667 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LIMK1P53667 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIMK1P53667 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIMK1P53667 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIMK1P53667 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIMK1P53667 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIMK1P53667 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LIMK1P53667 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIMK1P53667 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIMK1P53667 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIMK1P53667 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIMK1P53667 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LIMK1P53667 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIMK1P53667 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIMK1P53667 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIMK1P53667 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIMK1P53667 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIMK1P53667 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIMK1P53667 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIMK1P53667 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIMK1P53667 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIMK1P53667 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIMK1P53667 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIMK1P53667 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIMK1P53667 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIMK1P53667 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIMK1P53667 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIMK1P53667 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIMK1P53667 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIMK1P53667 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIMK1P53667 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIMK1P53667 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIMK1P53667 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIMK1P53667 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LIMK1P53667 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LIMK1P53667 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LIMK1P53667 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LIMK1P53667 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LIMK1P53667 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LIMK1P53667 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LIMK1P53667 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LIMK1P53667 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LIMK1P53667 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LIMK1P53667 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LIMK1P53667 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LIMK1P53667 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LIMK1P53667 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LIMK1P53667 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LIMK1P53667 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LIMK1P53667 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LIMK1P53667 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LIMK1P53667 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LIMK1P53667 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LIMK1P53667 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LIMK1P53667 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LIMK1P53667 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LIMK1P53667 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LIMK1P53667 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LIMK1P53667 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LIMK1P53667 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms