Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NUBP1P53384 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUBP1P53384 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUBP1P53384 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUBP1P53384 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUBP1P53384 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUBP1P53384 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUBP1P53384 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUBP1P53384 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUBP1P53384 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUBP1P53384 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUBP1P53384 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUBP1P53384 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NUBP1P53384 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUBP1P53384 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUBP1P53384 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUBP1P53384 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUBP1P53384 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUBP1P53384 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUBP1P53384 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUBP1P53384 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUBP1P53384 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUBP1P53384 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUBP1P53384 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUBP1P53384 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUBP1P53384 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUBP1P53384 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUBP1P53384 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUBP1P53384 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUBP1P53384 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUBP1P53384 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUBP1P53384 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUBP1P53384 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUBP1P53384 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUBP1P53384 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUBP1P53384 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NUBP1P53384 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUBP1P53384 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUBP1P53384 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUBP1P53384 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUBP1P53384 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUBP1P53384 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUBP1P53384 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUBP1P53384 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NUBP1P53384 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUBP1P53384 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUBP1P53384 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUBP1P53384 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NUBP1P53384 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUBP1P53384 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUBP1P53384 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUBP1P53384 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUBP1P53384 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUBP1P53384 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUBP1P53384 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUBP1P53384 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUBP1P53384 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NUBP1P53384 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUBP1P53384 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUBP1P53384 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUBP1P53384 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUBP1P53384 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUBP1P53384 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUBP1P53384 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUBP1P53384 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUBP1P53384 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUBP1P53384 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUBP1P53384 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUBP1P53384 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUBP1P53384 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUBP1P53384 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUBP1P53384 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUBP1P53384 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUBP1P53384 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUBP1P53384 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUBP1P53384 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUBP1P53384 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUBP1P53384 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms