Protein–RNA interactions for Protein: P51513

NOVA1, RNA-binding protein Nova-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOVA1P51513 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOVA1P51513 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOVA1P51513 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOVA1P51513 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOVA1P51513 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOVA1P51513 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOVA1P51513 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOVA1P51513 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOVA1P51513 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOVA1P51513 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOVA1P51513 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOVA1P51513 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOVA1P51513 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOVA1P51513 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOVA1P51513 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOVA1P51513 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOVA1P51513 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOVA1P51513 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOVA1P51513 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOVA1P51513 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOVA1P51513 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOVA1P51513 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOVA1P51513 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOVA1P51513 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOVA1P51513 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOVA1P51513 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOVA1P51513 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NOVA1P51513 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOVA1P51513 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOVA1P51513 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOVA1P51513 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOVA1P51513 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOVA1P51513 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOVA1P51513 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOVA1P51513 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOVA1P51513 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NOVA1P51513 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOVA1P51513 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOVA1P51513 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOVA1P51513 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NOVA1P51513 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOVA1P51513 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOVA1P51513 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOVA1P51513 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOVA1P51513 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOVA1P51513 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOVA1P51513 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOVA1P51513 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOVA1P51513 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOVA1P51513 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOVA1P51513 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOVA1P51513 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOVA1P51513 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOVA1P51513 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOVA1P51513 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NOVA1P51513 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOVA1P51513 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOVA1P51513 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOVA1P51513 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOVA1P51513 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms