Protein–RNA interactions for Protein: P50592

Tnfsf10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf10P50592 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf10P50592 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf10P50592 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf10P50592 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf10P50592 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf10P50592 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf10P50592 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf10P50592 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf10P50592 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsf10P50592 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsf10P50592 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsf10P50592 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf10P50592 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf10P50592 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf10P50592 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf10P50592 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsf10P50592 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf10P50592 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf10P50592 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf10P50592 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf10P50592 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf10P50592 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf10P50592 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsf10P50592 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf10P50592 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf10P50592 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf10P50592 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf10P50592 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf10P50592 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf10P50592 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf10P50592 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsf10P50592 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsf10P50592 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsf10P50592 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsf10P50592 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfsf10P50592 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfsf10P50592 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf10P50592 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf10P50592 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf10P50592 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf10P50592 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf10P50592 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf10P50592 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnfsf10P50592 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnfsf10P50592 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnfsf10P50592 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfsf10P50592 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf10P50592 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf10P50592 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf10P50592 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf10P50592 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf10P50592 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf10P50592 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf10P50592 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf10P50592 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf10P50592 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf10P50592 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf10P50592 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf10P50592 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf10P50592 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf10P50592 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf10P50592 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf10P50592 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsf10P50592 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms