Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFCP49767 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFCP49767 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFCP49767 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFCP49767 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFCP49767 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFCP49767 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFCP49767 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFCP49767 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFCP49767 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFCP49767 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFCP49767 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFCP49767 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFCP49767 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFCP49767 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFCP49767 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VEGFCP49767 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFCP49767 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VEGFCP49767 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFCP49767 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFCP49767 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFCP49767 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFCP49767 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFCP49767 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFCP49767 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFCP49767 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFCP49767 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFCP49767 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFCP49767 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFCP49767 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFCP49767 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFCP49767 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFCP49767 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFCP49767 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFCP49767 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VEGFCP49767 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms