Protein–RNA interactions for Protein: P48634

PRRC2A, Protein PRRC2A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC2AP48634 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRRC2AP48634 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRC2AP48634 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRC2AP48634 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRRC2AP48634 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRRC2AP48634 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRRC2AP48634 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRRC2AP48634 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRRC2AP48634 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PRRC2AP48634 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRRC2AP48634 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRC2AP48634 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRC2AP48634 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRRC2AP48634 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRC2AP48634 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRC2AP48634 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRRC2AP48634 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRC2AP48634 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRC2AP48634 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRC2AP48634 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRC2AP48634 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRC2AP48634 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRC2AP48634 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRC2AP48634 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRC2AP48634 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRC2AP48634 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRC2AP48634 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRC2AP48634 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRC2AP48634 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRC2AP48634 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRC2AP48634 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRC2AP48634 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRC2AP48634 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRC2AP48634 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRRC2AP48634 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRC2AP48634 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRC2AP48634 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRC2AP48634 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRC2AP48634 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRC2AP48634 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRC2AP48634 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRC2AP48634 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRC2AP48634 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRC2AP48634 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRC2AP48634 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRC2AP48634 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRC2AP48634 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRC2AP48634 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRC2AP48634 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRC2AP48634 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRC2AP48634 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRRC2AP48634 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRC2AP48634 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRC2AP48634 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRC2AP48634 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRC2AP48634 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRC2AP48634 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2AP48634 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2AP48634 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2AP48634 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2AP48634 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2AP48634 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRC2AP48634 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC2AP48634 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC2AP48634 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC2AP48634 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRC2AP48634 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRC2AP48634 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC2AP48634 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC2AP48634 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC2AP48634 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC2AP48634 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRC2AP48634 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC2AP48634 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRRC2AP48634 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms