Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
THPOP40225 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
THPOP40225 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
THPOP40225 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
THPOP40225 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
THPOP40225 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
THPOP40225 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
THPOP40225 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
THPOP40225 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
THPOP40225 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
THPOP40225 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
THPOP40225 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
THPOP40225 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
THPOP40225 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
THPOP40225 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
THPOP40225 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
THPOP40225 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
THPOP40225 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
THPOP40225 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
THPOP40225 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
THPOP40225 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
THPOP40225 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
THPOP40225 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
THPOP40225 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
THPOP40225 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
THPOP40225 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
THPOP40225 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
THPOP40225 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
THPOP40225 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
THPOP40225 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
THPOP40225 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
THPOP40225 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
THPOP40225 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
THPOP40225 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
THPOP40225 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
THPOP40225 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
THPOP40225 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
THPOP40225 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
THPOP40225 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
THPOP40225 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
THPOP40225 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
THPOP40225 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
THPOP40225 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
THPOP40225 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
THPOP40225 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
THPOP40225 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
THPOP40225 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
THPOP40225 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
THPOP40225 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
THPOP40225 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
THPOP40225 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
THPOP40225 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
THPOP40225 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
THPOP40225 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
THPOP40225 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
THPOP40225 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
THPOP40225 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
THPOP40225 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
THPOP40225 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
THPOP40225 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
THPOP40225 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
THPOP40225 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
THPOP40225 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
THPOP40225 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
THPOP40225 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
THPOP40225 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
THPOP40225 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
THPOP40225 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
THPOP40225 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
THPOP40225 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
THPOP40225 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
THPOP40225 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
THPOP40225 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
THPOP40225 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
THPOP40225 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
THPOP40225 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
THPOP40225 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
THPOP40225 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
THPOP40225 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
THPOP40225 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
THPOP40225 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
THPOP40225 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
THPOP40225 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
THPOP40225 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
THPOP40225 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
THPOP40225 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
THPOP40225 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
THPOP40225 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
THPOP40225 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
THPOP40225 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
THPOP40225 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
THPOP40225 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
THPOP40225 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
THPOP40225 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
THPOP40225 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
THPOP40225 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
THPOP40225 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
THPOP40225 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
THPOP40225 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
THPOP40225 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms