Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 UBA4YHR111W 1323 nt8.6□□□□□ -1.03
DDI1P40087 RSC8YFR037C 1674 nt8.6□□□□□ -1.03
DDI1P40087 FMS1YMR020W 1527 nt8.59□□□□□ -1.03
DDI1P40087 COQ2YNR041C 1119 nt8.59□□□□□ -1.03
DDI1P40087 FIT3YOR383C 615 nt8.59□□□□□ -1.03
DDI1P40087 RFC1YOR217W 2586 nt8.59□□□□□ -1.03
DDI1P40087 MEP3YPR138C 1470 nt8.58□□□□□ -1.04
DDI1P40087 CLB6YGR109C 1143 nt8.58□□□□□ -1.04
DDI1P40087 YMR103CYMR103C 363 nt8.58□□□□□ -1.04
DDI1P40087 ZTA1YBR046C 1005 nt8.58□□□□□ -1.04
DDI1P40087 DIG1YPL049C 1359 nt8.58□□□□□ -1.04
DDI1P40087 DTR1YBR180W 1719 nt8.57□□□□□ -1.04
DDI1P40087 ACH1YBL015W 1581 nt8.57□□□□□ -1.04
DDI1P40087 UTH1YKR042W 1098 nt8.57□□□□□ -1.04
DDI1P40087 YSR3YKR053C 1215 nt8.57□□□□□ -1.04
DDI1P40087 YCR087WYCR087W 516 nt8.56□□□□□ -1.04
DDI1P40087 RRT5YFR032C 870 nt8.56□□□□□ -1.04
DDI1P40087 MIR1YJR077C 936 nt8.56□□□□□ -1.04
DDI1P40087 YPS3YLR121C 1527 nt8.54□□□□□ -1.04
DDI1P40087 TOK1YJL093C 2076 nt8.53□□□□□ -1.04
DDI1P40087 GID8YMR135C 1368 nt8.53□□□□□ -1.04
DDI1P40087 ZAP1YJL056C 2643 nt8.53□□□□□ -1.04
DDI1P40087 RPL4BYDR012W 1089 nt8.52□□□□□ -1.05
DDI1P40087 RPL4AYBR031W 1089 nt8.52□□□□□ -1.05
DDI1P40087 FLR1YBR008C 1647 nt8.51□□□□□ -1.05
DDI1P40087 ODC1YPL134C 933 nt8.51□□□□□ -1.05
DDI1P40087 SEC61YLR378C 1443 nt8.51□□□□□ -1.05
DDI1P40087 MTO1YGL236C 2010 nt8.51□□□□□ -1.05
DDI1P40087 DLD2YDL178W 1593 nt8.5□□□□□ -1.05
DDI1P40087 SBA1YKL117W 651 nt8.49□□□□□ -1.05
DDI1P40087 YKL133CYKL133C 1392 nt8.48□□□□□ -1.05
DDI1P40087 THI74YDR438W 1113 nt8.47□□□□□ -1.05
DDI1P40087 PAU16YKL224C 372 nt8.47□□□□□ -1.05
DDI1P40087 MRS6YOR370C 1812 nt8.46□□□□□ -1.06
DDI1P40087 OXA1YER154W 1209 nt8.46□□□□□ -1.06
DDI1P40087 XYL2YLR070C 1071 nt8.44□□□□□ -1.06
DDI1P40087 YHR218WYHR218W 1812 nt8.43□□□□□ -1.06
DDI1P40087 YOR072WYOR072W 315 nt8.43□□□□□ -1.06
DDI1P40087 SSL2YIL143C 2532 nt8.42□□□□□ -1.06
DDI1P40087 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.42□□□□□ -1.06
DDI1P40087 RPS14BYJL191W 417 nt8.42□□□□□ -1.06
DDI1P40087 PCP1YGR101W 1041 nt8.41□□□□□ -1.06
DDI1P40087 MDM35YKL053C-A 261 nt8.41□□□□□ -1.06
DDI1P40087 AIM45YPR004C 1035 nt8.41□□□□□ -1.06
DDI1P40087 YER188WYER188W 720 nt8.4□□□□□ -1.06
DDI1P40087 MDL2YPL270W 2322 nt8.39□□□□□ -1.07
DDI1P40087 HEM13YDR044W 987 nt8.39□□□□□ -1.07
DDI1P40087 OSH7YHR001W 1314 nt8.38□□□□□ -1.07
DDI1P40087 TIM44YIL022W 1296 nt8.38□□□□□ -1.07
DDI1P40087 YHR219WYHR219W 1875 nt8.37□□□□□ -1.07
DDI1P40087 AIM1YAL046C 357 nt8.37□□□□□ -1.07
DDI1P40087 YLR046CYLR046C 813 nt8.37□□□□□ -1.07
DDI1P40087 HXT10YFL011W 1641 nt8.36□□□□□ -1.07
DDI1P40087 BNI5YNL166C 1347 nt8.36□□□□□ -1.07
DDI1P40087 NAT4YMR069W 858 nt8.36□□□□□ -1.07
DDI1P40087 PHO23YNL097C 993 nt8.36□□□□□ -1.07
DDI1P40087 LSR1LSR1 1175 nt8.36□□□□□ -1.07
DDI1P40087 YRF1-2YER190W 5046 nt8.36□□□□□ -1.07
DDI1P40087 YGL034CYGL034C 366 nt8.35□□□□□ -1.07
DDI1P40087 BSP1YPR171W 1731 nt8.34□□□□□ -1.07
DDI1P40087 RPD3YNL330C 1302 nt8.34□□□□□ -1.07
DDI1P40087 CWP2YKL096W-A 279 nt8.34□□□□□ -1.07
DDI1P40087 FUB1YCR076C 753 nt8.33□□□□□ -1.08
DDI1P40087 ENT4YLL038C 744 nt8.33□□□□□ -1.08
DDI1P40087 TSC10YBR265W 963 nt8.33□□□□□ -1.08
DDI1P40087 MSC1YML128C 1542 nt8.33□□□□□ -1.08
DDI1P40087 MSF1YPR047W 1410 nt8.32□□□□□ -1.08
DDI1P40087 MEX67YPL169C 1800 nt8.32□□□□□ -1.08
DDI1P40087 APT2YDR441C 546 nt8.31□□□□□ -1.08
DDI1P40087 DLD3YEL071W 1491 nt8.31□□□□□ -1.08
DDI1P40087 NUC1YJL208C 990 nt8.29□□□□□ -1.08
DDI1P40087 RAS2YNL098C 969 nt8.29□□□□□ -1.08
DDI1P40087 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.28□□□□□ -1.08
DDI1P40087 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.28□□□□□ -1.08
DDI1P40087 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.28□□□□□ -1.08
DDI1P40087 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.28□□□□□ -1.08
DDI1P40087 YLR279WYLR279W 390 nt8.28□□□□□ -1.08
DDI1P40087 SOL2YCR073W-A 948 nt8.27□□□□□ -1.09
DDI1P40087 TIP1YBR067C 633 nt8.27□□□□□ -1.09
DDI1P40087 YMR262WYMR262W 942 nt8.26□□□□□ -1.09
DDI1P40087 TPN1YGL186C 1740 nt8.26□□□□□ -1.09
DDI1P40087 TAT2YOL020W 1779 nt8.25□□□□□ -1.09
DDI1P40087 GPN2YOR262W 1044 nt8.25□□□□□ -1.09
DDI1P40087 AGP3YFL055W 1677 nt8.24□□□□□ -1.09
DDI1P40087 RBG1YAL036C 1110 nt8.24□□□□□ -1.09
DDI1P40087 SDH5YOL071W 489 nt8.24□□□□□ -1.09
DDI1P40087 FCY21YER060W 1587 nt8.23□□□□□ -1.09
DDI1P40087 VMA11YPL234C 495 nt8.23□□□□□ -1.09
DDI1P40087 MSB4YOL112W 1479 nt8.23□□□□□ -1.09
DDI1P40087 NBA1YOL070C 1506 nt8.23□□□□□ -1.09
DDI1P40087 INH1YDL181W 258 nt8.21□□□□□ -1.1
DDI1P40087 YGR012WYGR012W 1182 nt8.21□□□□□ -1.1
DDI1P40087 ITR2YOL103W 1830 nt8.21□□□□□ -1.1
DDI1P40087 ALR1YOL130W 2580 nt8.2□□□□□ -1.1
DDI1P40087 KRR1YCL059C 951 nt8.2□□□□□ -1.1
DDI1P40087 LSB5YCL034W 1065 nt8.2□□□□□ -1.1
DDI1P40087 CSM1YCR086W 573 nt8.19□□□□□ -1.1
DDI1P40087 UFD1YGR048W 1086 nt8.19□□□□□ -1.1
DDI1P40087 RPC31YNL151C 756 nt8.19□□□□□ -1.1
DDI1P40087 TOM71YHR117W 1920 nt8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 63.8 ms