Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 TOA2YKL058W 369 nt8.89□□□□□ -0.99
YAR028WP39548 RPL4AYBR031W 1089 nt8.89□□□□□ -0.99
YAR028WP39548 FIT3YOR383C 615 nt8.89□□□□□ -0.99
YAR028WP39548 OYE3YPL171C 1203 nt8.89□□□□□ -0.99
YAR028WP39548 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.88□□□□□ -0.99
YAR028WP39548 XYL2YLR070C 1071 nt8.88□□□□□ -0.99
YAR028WP39548 PET8YNL003C 855 nt8.87□□□□□ -0.99
YAR028WP39548 CCT2YIL142W 1584 nt8.86□□□□□ -0.99
YAR028WP39548 COQ8YGL119W 1506 nt8.85□□□□□ -0.99
YAR028WP39548 HMT1YBR034C 1047 nt8.85□□□□□ -0.99
YAR028WP39548 MSF1YPR047W 1410 nt8.85□□□□□ -0.99
YAR028WP39548 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.84□□□□□ -0.99
YAR028WP39548 AIM45YPR004C 1035 nt8.84□□□□□ -0.99
YAR028WP39548 GND2YGR256W 1479 nt8.83□□□□□ -1
YAR028WP39548 RPS14BYJL191W 417 nt8.83□□□□□ -1
YAR028WP39548 NAT4YMR069W 858 nt8.83□□□□□ -1
YAR028WP39548 ARO8YGL202W 1503 nt8.82□□□□□ -1
YAR028WP39548 HIS2YFR025C 1008 nt8.82□□□□□ -1
YAR028WP39548 YGL034CYGL034C 366 nt8.82□□□□□ -1
YAR028WP39548 SBA1YKL117W 651 nt8.81□□□□□ -1
YAR028WP39548 UGP1YKL035W 1500 nt8.8□□□□□ -1
YAR028WP39548 MEP3YPR138C 1470 nt8.79□□□□□ -1
YAR028WP39548 BNS1YGR230W 414 nt8.79□□□□□ -1
YAR028WP39548 YMR103CYMR103C 363 nt8.79□□□□□ -1
YAR028WP39548 ACH1YBL015W 1581 nt8.78□□□□□ -1
YAR028WP39548 SPP2YOR148C 558 nt8.78□□□□□ -1
YAR028WP39548 YPL071CYPL071C 471 nt8.78□□□□□ -1
YAR028WP39548 FMS1YMR020W 1527 nt8.78□□□□□ -1
YAR028WP39548 KES1YPL145C 1305 nt8.78□□□□□ -1
YAR028WP39548 LSB6YJL100W 1824 nt8.77□□□□□ -1
YAR028WP39548 SGA1YIL099W 1650 nt8.76□□□□□ -1.01
YAR028WP39548 ARP10YDR106W 855 nt8.76□□□□□ -1.01
YAR028WP39548 PUS5YLR165C 765 nt8.76□□□□□ -1.01
YAR028WP39548 RSC8YFR037C 1674 nt8.75□□□□□ -1.01
YAR028WP39548 FAF1YIL019W 1041 nt8.75□□□□□ -1.01
YAR028WP39548 REC114YMR133W 1287 nt8.75□□□□□ -1.01
YAR028WP39548 BET2YPR176C 978 nt8.75□□□□□ -1.01
YAR028WP39548 SAM2YDR502C 1155 nt8.74□□□□□ -1.01
YAR028WP39548 UTP6YDR449C 1323 nt8.74□□□□□ -1.01
YAR028WP39548 YPS3YLR121C 1527 nt8.74□□□□□ -1.01
YAR028WP39548 YMR209CYMR209C 1374 nt8.73□□□□□ -1.01
YAR028WP39548 FLR1YBR008C 1647 nt8.73□□□□□ -1.01
YAR028WP39548 MAE1YKL029C 2010 nt8.73□□□□□ -1.01
YAR028WP39548 VPS62YGR141W 1404 nt8.72□□□□□ -1.01
YAR028WP39548 NAS6YGR232W 687 nt8.72□□□□□ -1.01
YAR028WP39548 RSC4YKR008W 1878 nt8.72□□□□□ -1.01
YAR028WP39548 SEC61YLR378C 1443 nt8.71□□□□□ -1.01
YAR028WP39548 OXA1YER154W 1209 nt8.71□□□□□ -1.02
YAR028WP39548 YDL086WYDL086W 822 nt8.7□□□□□ -1.02
YAR028WP39548 UBX6YJL048C 1191 nt8.7□□□□□ -1.02
YAR028WP39548 TSC10YBR265W 963 nt8.7□□□□□ -1.02
YAR028WP39548 FHN1YGR131W 525 nt8.69□□□□□ -1.02
YAR028WP39548 DLD2YDL178W 1593 nt8.69□□□□□ -1.02
YAR028WP39548 UGA4YDL210W 1716 nt8.68□□□□□ -1.02
YAR028WP39548 RBG1YAL036C 1110 nt8.68□□□□□ -1.02
YAR028WP39548 YLR279WYLR279W 390 nt8.68□□□□□ -1.02
YAR028WP39548 ATG17YLR423C 1254 nt8.68□□□□□ -1.02
YAR028WP39548 ZAP1YJL056C 2643 nt8.67□□□□□ -1.02
YAR028WP39548 QDR2YIL121W 1629 nt8.67□□□□□ -1.02
YAR028WP39548 SSN3YPL042C 1668 nt8.65□□□□□ -1.02
YAR028WP39548 DIG1YPL049C 1359 nt8.64□□□□□ -1.03
YAR028WP39548 SEM1YDR363W-A 270 nt8.64□□□□□ -1.03
YAR028WP39548 KDX1YKL161C 1302 nt8.63□□□□□ -1.03
YAR028WP39548 HEM13YDR044W 987 nt8.63□□□□□ -1.03
YAR028WP39548 MSB4YOL112W 1479 nt8.63□□□□□ -1.03
YAR028WP39548 APT2YDR441C 546 nt8.62□□□□□ -1.03
YAR028WP39548 ACO2YJL200C 2370 nt8.62□□□□□ -1.03
YAR028WP39548 BNI5YNL166C 1347 nt8.61□□□□□ -1.03
YAR028WP39548 YER188WYER188W 720 nt8.61□□□□□ -1.03
YAR028WP39548 PHO23YNL097C 993 nt8.61□□□□□ -1.03
YAR028WP39548 YGR012WYGR012W 1182 nt8.6□□□□□ -1.03
YAR028WP39548 FCY21YER060W 1587 nt8.6□□□□□ -1.03
YAR028WP39548 GID8YMR135C 1368 nt8.6□□□□□ -1.03
YAR028WP39548 MSC1YML128C 1542 nt8.59□□□□□ -1.03
YAR028WP39548 FUB1YCR076C 753 nt8.59□□□□□ -1.03
YAR028WP39548 SDH5YOL071W 489 nt8.58□□□□□ -1.04
YAR028WP39548 PSD1YNL169C 1503 nt8.57□□□□□ -1.04
YAR028WP39548 DMA2YNL116W 1569 nt8.56□□□□□ -1.04
YAR028WP39548 ODC1YPL134C 933 nt8.56□□□□□ -1.04
YAR028WP39548 OSH7YHR001W 1314 nt8.54□□□□□ -1.04
YAR028WP39548 MRS6YOR370C 1812 nt8.54□□□□□ -1.04
YAR028WP39548 YKL133CYKL133C 1392 nt8.54□□□□□ -1.04
YAR028WP39548 CYT1YOR065W 930 nt8.53□□□□□ -1.04
YAR028WP39548 SSL2YIL143C 2532 nt8.53□□□□□ -1.04
YAR028WP39548 CSM1YCR086W 573 nt8.52□□□□□ -1.05
YAR028WP39548 YHR219WYHR219W 1875 nt8.51□□□□□ -1.05
YAR028WP39548 AIM1YAL046C 357 nt8.5□□□□□ -1.05
YAR028WP39548 SKG1YKR100C 1068 nt8.5□□□□□ -1.05
YAR028WP39548 SWP1YMR149W 861 nt8.5□□□□□ -1.05
YAR028WP39548 MAS1YLR163C 1389 nt8.49□□□□□ -1.05
YAR028WP39548 NUC1YJL208C 990 nt8.49□□□□□ -1.05
YAR028WP39548 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.49□□□□□ -1.05
YAR028WP39548 TAT2YOL020W 1779 nt8.48□□□□□ -1.05
YAR028WP39548 RAD23YEL037C 1197 nt8.48□□□□□ -1.05
YAR028WP39548 PRY1YJL079C 900 nt8.48□□□□□ -1.05
YAR028WP39548 GID7YCL039W 2238 nt8.48□□□□□ -1.05
YAR028WP39548 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.47□□□□□ -1.05
YAR028WP39548 CWP2YKL096W-A 279 nt8.47□□□□□ -1.05
YAR028WP39548 ENT4YLL038C 744 nt8.47□□□□□ -1.05
YAR028WP39548 RAS2YNL098C 969 nt8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.3 ms