Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC6A2P23975 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC6A2P23975 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC6A2P23975 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A2P23975 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A2P23975 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A2P23975 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A2P23975 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC6A2P23975 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A2P23975 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A2P23975 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A2P23975 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A2P23975 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A2P23975 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A2P23975 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC6A2P23975 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC6A2P23975 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC6A2P23975 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC6A2P23975 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC6A2P23975 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC6A2P23975 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC6A2P23975 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC6A2P23975 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC6A2P23975 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC6A2P23975 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC6A2P23975 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC6A2P23975 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC6A2P23975 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC6A2P23975 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A2P23975 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A2P23975 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A2P23975 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A2P23975 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A2P23975 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A2P23975 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A2P23975 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC6A2P23975 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC6A2P23975 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A2P23975 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A2P23975 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A2P23975 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A2P23975 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A2P23975 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A2P23975 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A2P23975 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A2P23975 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A2P23975 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A2P23975 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC6A2P23975 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC6A2P23975 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC6A2P23975 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A2P23975 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A2P23975 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A2P23975 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC6A2P23975 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A2P23975 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A2P23975 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A2P23975 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A2P23975 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A2P23975 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A2P23975 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A2P23975 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A2P23975 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A2P23975 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A2P23975 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A2P23975 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A2P23975 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A2P23975 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A2P23975 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A2P23975 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A2P23975 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A2P23975 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms