Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTF3P20783 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NTF3P20783 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTF3P20783 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTF3P20783 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NTF3P20783 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NTF3P20783 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NTF3P20783 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTF3P20783 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTF3P20783 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTF3P20783 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NTF3P20783 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTF3P20783 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NTF3P20783 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTF3P20783 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTF3P20783 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTF3P20783 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NTF3P20783 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTF3P20783 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTF3P20783 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTF3P20783 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTF3P20783 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTF3P20783 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTF3P20783 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTF3P20783 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NTF3P20783 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTF3P20783 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTF3P20783 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NTF3P20783 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTF3P20783 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTF3P20783 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTF3P20783 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTF3P20783 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTF3P20783 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTF3P20783 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTF3P20783 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTF3P20783 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTF3P20783 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTF3P20783 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTF3P20783 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NTF3P20783 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTF3P20783 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTF3P20783 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTF3P20783 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTF3P20783 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTF3P20783 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTF3P20783 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTF3P20783 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTF3P20783 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTF3P20783 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTF3P20783 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTF3P20783 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTF3P20783 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTF3P20783 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTF3P20783 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NTF3P20783 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NTF3P20783 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NTF3P20783 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTF3P20783 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTF3P20783 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTF3P20783 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTF3P20783 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NTF3P20783 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF3P20783 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF3P20783 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTF3P20783 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTF3P20783 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTF3P20783 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTF3P20783 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTF3P20783 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTF3P20783 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTF3P20783 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTF3P20783 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTF3P20783 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTF3P20783 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTF3P20783 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTF3P20783 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTF3P20783 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTF3P20783 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTF3P20783 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NTF3P20783 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NTF3P20783 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NTF3P20783 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NTF3P20783 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTF3P20783 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTF3P20783 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTF3P20783 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NTF3P20783 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTF3P20783 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTF3P20783 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTF3P20783 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTF3P20783 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTF3P20783 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTF3P20783 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTF3P20783 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTF3P20783 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NTF3P20783 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTF3P20783 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NTF3P20783 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NTF3P20783 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms